中国海洋大学学报（自然科学版）
中國海洋大學學報（自然科學版）
중국해양대학학보（자연과학판）
PERIODICAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA
2006年
2期
249-254,272
,共7页
崔建洲%申雪艳%杨官品%宫庆礼%顾谦群
崔建洲%申雪豔%楊官品%宮慶禮%顧謙群
최건주%신설염%양관품%궁경례%고겸군
红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)%微卫星%基因组
紅鰭東方鲀(Takifugu rubripes)%微衛星%基因組
홍기동방돈(Takifugu rubripes)%미위성%기인조
对河豚基因组微卫星分布特征进行研究,在约365Mb基因组序列中共找到49 647个微卫星序列,平均每隔7 351个碱基就有1个.微卫星序列长度主要分布在20～60个碱基的长度范围内.全部微卫星序列重复区长度(2 802 374bp)占整个基因组的比例为0.77%.两碱基重复类型数目最多,为35 339个,占总数的71.30%;其次是四碱基类型,6 837个,占13.77%;再次分别是三碱基类型3 548个,占7.14%,五碱基类型1 856个,占3.73%,六碱基类型1 605个,占3.23%,单碱基类型最少,共402个,占0.80%.按降序排列,出现最多的前20个微卫星重复类别为:CA, TG, GT, AC, GA, CT, TC, TA, AG, AT, TCCA, ATCC, TCTG, GATG, ATCT, CATC, TGGA, ATGG, GATA, GAG,占全部微卫星序列的75.21%.在河豚基因组中未发现GC微卫星序列的存在.与其它生物基因组中微卫星分布特征相比,河豚基因组具有更高的简洁性.本研究将为研究河豚微卫星标记、研究其群体遗传多样性,进行不同基因组的比较研究提供基础.
對河豚基因組微衛星分佈特徵進行研究,在約365Mb基因組序列中共找到49 647箇微衛星序列,平均每隔7 351箇堿基就有1箇.微衛星序列長度主要分佈在20～60箇堿基的長度範圍內.全部微衛星序列重複區長度(2 802 374bp)佔整箇基因組的比例為0.77%.兩堿基重複類型數目最多,為35 339箇,佔總數的71.30%;其次是四堿基類型,6 837箇,佔13.77%;再次分彆是三堿基類型3 548箇,佔7.14%,五堿基類型1 856箇,佔3.73%,六堿基類型1 605箇,佔3.23%,單堿基類型最少,共402箇,佔0.80%.按降序排列,齣現最多的前20箇微衛星重複類彆為:CA, TG, GT, AC, GA, CT, TC, TA, AG, AT, TCCA, ATCC, TCTG, GATG, ATCT, CATC, TGGA, ATGG, GATA, GAG,佔全部微衛星序列的75.21%.在河豚基因組中未髮現GC微衛星序列的存在.與其它生物基因組中微衛星分佈特徵相比,河豚基因組具有更高的簡潔性.本研究將為研究河豚微衛星標記、研究其群體遺傳多樣性,進行不同基因組的比較研究提供基礎.
대하돈기인조미위성분포특정진행연구,재약365Mb기인조서렬중공조도49 647개미위성서렬,평균매격7 351개감기취유1개.미위성서렬장도주요분포재20～60개감기적장도범위내.전부미위성서렬중복구장도(2 802 374bp)점정개기인조적비례위0.77%.량감기중복류형수목최다,위35 339개,점총수적71.30%;기차시사감기류형,6 837개,점13.77%;재차분별시삼감기류형3 548개,점7.14%,오감기류형1 856개,점3.73%,륙감기류형1 605개,점3.23%,단감기류형최소,공402개,점0.80%.안강서배렬,출현최다적전20개미위성중복유별위:CA, TG, GT, AC, GA, CT, TC, TA, AG, AT, TCCA, ATCC, TCTG, GATG, ATCT, CATC, TGGA, ATGG, GATA, GAG,점전부미위성서렬적75.21%.재하돈기인조중미발현GC미위성서렬적존재.여기타생물기인조중미위성분포특정상비,하돈기인조구유경고적간길성.본연구장위연구하돈미위성표기、연구기군체유전다양성,진행불동기인조적비교연구제공기출.
