中国水产科学
中國水產科學
중국수산과학
Journal of Fishery Sciences of China
2007年
3期
352-360
,共9页
邵爱华%朱江%史全良%陈葵
邵愛華%硃江%史全良%陳葵
소애화%주강%사전량%진규
暗纹东方鲀%mtDNA控制区%系统关系
暗紋東方鲀%mtDNA控製區%繫統關繫
암문동방돈%mtDNA공제구%계통관계
以暗纹东方鲀(Takifugufasciatus)肝脏线粒体DNA为模板,参照GenBank中红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,获得了暗纹东方鲀线粒体DNA控制区基因(818 bp)及5'端上游的tRNAPro基因(71 bp)的全序列.控制区碱基组成为T 32.2%,C 19.1%,A 35.6%,G13.2%.对照其他已报道的鱼类控制区结构,对暗纹东方鲀控制区的结构进行了分析,识别了其终止序列区、中央保守区和保守序列区,找到了终止相关的序列TAS以及保守序列(CSB1,CSB2,CSB3).CSB1、GSB2序列相对保守,TAS与其回文基序可形成稳定的茎环结构,成为H-链复制延伸时的终止识别位点.同时运用DNA分析软件对暗纹东方鲀与GenBank中其他10多种鱼类的mtDNA控制区序列进行比对,并选取东方鲀属的7种鱼类mtDNA控制区序列构建分子系统树.结果显示控制区基因较适于鲀科鱼类中同属不同种的系统发育分析.
以暗紋東方鲀(Takifugufasciatus)肝髒線粒體DNA為模闆,參照GenBank中紅鰭東方鲀(Takifugu rubripes)線粒體DNA序列設計閤成特異引物進行PCR擴增,穫得瞭暗紋東方鲀線粒體DNA控製區基因(818 bp)及5'耑上遊的tRNAPro基因(71 bp)的全序列.控製區堿基組成為T 32.2%,C 19.1%,A 35.6%,G13.2%.對照其他已報道的魚類控製區結構,對暗紋東方鲀控製區的結構進行瞭分析,識彆瞭其終止序列區、中央保守區和保守序列區,找到瞭終止相關的序列TAS以及保守序列(CSB1,CSB2,CSB3).CSB1、GSB2序列相對保守,TAS與其迴文基序可形成穩定的莖環結構,成為H-鏈複製延伸時的終止識彆位點.同時運用DNA分析軟件對暗紋東方鲀與GenBank中其他10多種魚類的mtDNA控製區序列進行比對,併選取東方鲀屬的7種魚類mtDNA控製區序列構建分子繫統樹.結果顯示控製區基因較適于鲀科魚類中同屬不同種的繫統髮育分析.
이암문동방돈(Takifugufasciatus)간장선립체DNA위모판,삼조GenBank중홍기동방돈(Takifugu rubripes)선립체DNA서렬설계합성특이인물진행PCR확증,획득료암문동방돈선립체DNA공제구기인(818 bp)급5'단상유적tRNAPro기인(71 bp)적전서렬.공제구감기조성위T 32.2%,C 19.1%,A 35.6%,G13.2%.대조기타이보도적어류공제구결구,대암문동방돈공제구적결구진행료분석,식별료기종지서렬구、중앙보수구화보수서렬구,조도료종지상관적서렬TAS이급보수서렬(CSB1,CSB2,CSB3).CSB1、GSB2서렬상대보수,TAS여기회문기서가형성은정적경배결구,성위H-련복제연신시적종지식별위점.동시운용DNA분석연건대암문동방돈여GenBank중기타10다충어류적mtDNA공제구서렬진행비대,병선취동방돈속적7충어류mtDNA공제구서렬구건분자계통수.결과현시공제구기인교괄우돈과어류중동속불동충적계통발육분석.