激光生物学报
激光生物學報
격광생물학보
ACTA LASER BIOLOGY SINICA
2008年
1期
13-18
,共6页
PPI网络%社团结构%谱平分法
PPI網絡%社糰結構%譜平分法
PPI망락%사단결구%보평분법
蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络是生物网络的重要组成部分,也是后基因组时代的热点研究问题.揭示PPI网络中的社团结构,对于理解其复杂相瓦作用的结构和动态特征,了解活体细胞的结构和功能都有很大作用.但目前对于PPI网络结构的分析带有很强的试探性,还没有成熟可靠的方法.传统的谱平分法需要预先知道社团的个数,为了克服这一缺点,在尤向无权的PPI网络中使用改进后的基于Normal矩阵的谱平分法,得到了55个有牛物学意义的社团.实验结果表明:尽管PPI网络中的社团结构不是很明显,基于Normal矩阵的谱平分法依然可以有效地挖掘出其中具有生物学意义的社团结构.
蛋白質-蛋白質相互作用(protein-protein interaction,PPI)網絡是生物網絡的重要組成部分,也是後基因組時代的熱點研究問題.揭示PPI網絡中的社糰結構,對于理解其複雜相瓦作用的結構和動態特徵,瞭解活體細胞的結構和功能都有很大作用.但目前對于PPI網絡結構的分析帶有很彊的試探性,還沒有成熟可靠的方法.傳統的譜平分法需要預先知道社糰的箇數,為瞭剋服這一缺點,在尤嚮無權的PPI網絡中使用改進後的基于Normal矩陣的譜平分法,得到瞭55箇有牛物學意義的社糰.實驗結果錶明:儘管PPI網絡中的社糰結構不是很明顯,基于Normal矩陣的譜平分法依然可以有效地挖掘齣其中具有生物學意義的社糰結構.
단백질-단백질상호작용(protein-protein interaction,PPI)망락시생물망락적중요조성부분,야시후기인조시대적열점연구문제.게시PPI망락중적사단결구,대우리해기복잡상와작용적결구화동태특정,료해활체세포적결구화공능도유흔대작용.단목전대우PPI망락결구적분석대유흔강적시탐성,환몰유성숙가고적방법.전통적보평분법수요예선지도사단적개수,위료극복저일결점,재우향무권적PPI망락중사용개진후적기우Normal구진적보평분법,득도료55개유우물학의의적사단.실험결과표명:진관PPI망락중적사단결구불시흔명현,기우Normal구진적보평분법의연가이유효지알굴출기중구유생물학의의적사단결구.