郑州大学学报（医学版）
鄭州大學學報（醫學版）
정주대학학보（의학판）
JOURNAL OF ZHENGZHOU UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCES)
2010年
5期
743-746
,共4页
李瓅%曾昭书%周艳梅%董子明
李瓅%曾昭書%週豔梅%董子明
리력%증소서%주염매%동자명
祖先信息标记%单核苷酸多态性%固定系数%HapMap
祖先信息標記%單覈苷痠多態性%固定繫數%HapMap
조선신식표기%단핵감산다태성%고정계수%HapMap
目的:应用第10号染色体的HapMap单核苷酸多态性(SNP)基因分型数据及人群聚类分析技术区分人亚群.方法:从HapMap数据库(r23)获取北京汉族人、欧裔和非裔3个人群225个样本的第10号染色体共4660余万个SNPs分型结果,提取在3个群体间等位基因频率差值大于0.3的SNPs,以Genepop 4.0软件计算固定系数(Fst),以Structure 2.3软件进行聚类分析.结果:在3个群体间得到等位基因频率差值大于0.3的SNPs共2910个,位于该染色体长臂末端118000000 bp处的rs10510019、rs10787669、rs713252与rs919613的Fst均大于0.660,平均Fst为0.674,该4个SNPs处于强连锁不平衡状态,形成一个跨度为13455 bp的区域.结论:包含4个SNPs的祖先信息标记区域的发现,可以有效提示某个人是否归属于欧裔、非裔或北京汉族人群,并为组建复合PCR体系提供了备选SNPs.
目的:應用第10號染色體的HapMap單覈苷痠多態性(SNP)基因分型數據及人群聚類分析技術區分人亞群.方法:從HapMap數據庫(r23)穫取北京漢族人、歐裔和非裔3箇人群225箇樣本的第10號染色體共4660餘萬箇SNPs分型結果,提取在3箇群體間等位基因頻率差值大于0.3的SNPs,以Genepop 4.0軟件計算固定繫數(Fst),以Structure 2.3軟件進行聚類分析.結果:在3箇群體間得到等位基因頻率差值大于0.3的SNPs共2910箇,位于該染色體長臂末耑118000000 bp處的rs10510019、rs10787669、rs713252與rs919613的Fst均大于0.660,平均Fst為0.674,該4箇SNPs處于彊連鎖不平衡狀態,形成一箇跨度為13455 bp的區域.結論:包含4箇SNPs的祖先信息標記區域的髮現,可以有效提示某箇人是否歸屬于歐裔、非裔或北京漢族人群,併為組建複閤PCR體繫提供瞭備選SNPs.
목적:응용제10호염색체적HapMap단핵감산다태성(SNP)기인분형수거급인군취류분석기술구분인아군.방법:종HapMap수거고(r23)획취북경한족인、구예화비예3개인군225개양본적제10호염색체공4660여만개SNPs분형결과,제취재3개군체간등위기인빈솔차치대우0.3적SNPs,이Genepop 4.0연건계산고정계수(Fst),이Structure 2.3연건진행취류분석.결과:재3개군체간득도등위기인빈솔차치대우0.3적SNPs공2910개,위우해염색체장비말단118000000 bp처적rs10510019、rs10787669、rs713252여rs919613적Fst균대우0.660,평균Fst위0.674,해4개SNPs처우강련쇄불평형상태,형성일개과도위13455 bp적구역.결론:포함4개SNPs적조선신식표기구역적발현,가이유효제시모개인시부귀속우구예、비예혹북경한족인군,병위조건복합PCR체계제공료비선SNPs.
