动物医学进展
動物醫學進展
동물의학진전
PROGRESS IN VETERINARY MEDICINE
2012年
7期
12-18
,共7页
王建华%汪招雄%郭露铰%龚军%何艳兵%任涛
王建華%汪招雄%郭露鉸%龔軍%何豔兵%任濤
왕건화%왕초웅%곽로교%공군%하염병%임도
禽流感病毒%H6亚型%血凝素蛋白%线性抗原表位
禽流感病毒%H6亞型%血凝素蛋白%線性抗原錶位
금류감병독%H6아형%혈응소단백%선성항원표위
应用生物信息学方法预测H6亚型禽流感病毒血凝素蛋白(HA)线性抗原表位,并对所获表位的免疫原性进行初步鉴定,为流感病毒表位疫苗研制和H6亚型特异性ELISA检测方法奠定基础.依据近年流感病毒流行趋势,从GenBank下载具有代表性的H6、H5、H7和H9亚型禽流感病毒血凝素蛋白的氨基酸序列.利用DNA Star软件进行H6同亚型间氨基酸序列保守性分析,再将H6与H5、H7、H9不同亚型之间氨基酸同源性进行比较,然后借助在线服务器ExPASy和IEDB对序列进行抗原性、亲水性、柔韧性、二级结构和表面可及性预测.最后去除H6与H5、H7、H9亚型氨基酸同源区域,选择H6亚型氨基酸相对保守区域并且抗原表位综合预测结果较优的几个片段,所选择表位长度为15个氨基酸.合成所获得的优势线性表位,并用间接ELISA方法对所获表位的免疫原性进行鉴定.预测后获得4个线性抗原表位,经鉴定免疫原性最好的为表位A,最差的为表位B.
應用生物信息學方法預測H6亞型禽流感病毒血凝素蛋白(HA)線性抗原錶位,併對所穫錶位的免疫原性進行初步鑒定,為流感病毒錶位疫苗研製和H6亞型特異性ELISA檢測方法奠定基礎.依據近年流感病毒流行趨勢,從GenBank下載具有代錶性的H6、H5、H7和H9亞型禽流感病毒血凝素蛋白的氨基痠序列.利用DNA Star軟件進行H6同亞型間氨基痠序列保守性分析,再將H6與H5、H7、H9不同亞型之間氨基痠同源性進行比較,然後藉助在線服務器ExPASy和IEDB對序列進行抗原性、親水性、柔韌性、二級結構和錶麵可及性預測.最後去除H6與H5、H7、H9亞型氨基痠同源區域,選擇H6亞型氨基痠相對保守區域併且抗原錶位綜閤預測結果較優的幾箇片段,所選擇錶位長度為15箇氨基痠.閤成所穫得的優勢線性錶位,併用間接ELISA方法對所穫錶位的免疫原性進行鑒定.預測後穫得4箇線性抗原錶位,經鑒定免疫原性最好的為錶位A,最差的為錶位B.
응용생물신식학방법예측H6아형금류감병독혈응소단백(HA)선성항원표위,병대소획표위적면역원성진행초보감정,위류감병독표위역묘연제화H6아형특이성ELISA검측방법전정기출.의거근년류감병독류행추세,종GenBank하재구유대표성적H6、H5、H7화H9아형금류감병독혈응소단백적안기산서렬.이용DNA Star연건진행H6동아형간안기산서렬보수성분석,재장H6여H5、H7、H9불동아형지간안기산동원성진행비교,연후차조재선복무기ExPASy화IEDB대서렬진행항원성、친수성、유인성、이급결구화표면가급성예측.최후거제H6여H5、H7、H9아형안기산동원구역,선택H6아형안기산상대보수구역병차항원표위종합예측결과교우적궤개편단,소선택표위장도위15개안기산.합성소획득적우세선성표위,병용간접ELISA방법대소획표위적면역원성진행감정.예측후획득4개선성항원표위,경감정면역원성최호적위표위A,최차적위표위B.
