浙江农林大学学报
浙江農林大學學報
절강농림대학학보
JOURNAL OF ZHEJIANG FORESTRY COLLEGE
2012年
4期
626-633
,共8页
宋双%黄银芝%董雷鸣%黄有军%曾燕如%吴智敏
宋雙%黃銀芝%董雷鳴%黃有軍%曾燕如%吳智敏
송쌍%황은지%동뢰명%황유군%증연여%오지민
经济林学%EST-SSR%山核桃%cDNA文库
經濟林學%EST-SSR%山覈桃%cDNA文庫
경제림학%EST-SSR%산핵도%cDNA문고
基于山核桃Carya cathayensis脂肪代谢相关cDNA文库的部分测序结果,发现43条cDNA序列具有简单重复序列(SSR)碱基重复特点,用Primer Premier 5设计了34对表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)引物；建立了适用于山核桃的SSR分析体系,并用设计的SSR引物对对天然群体山核桃40个样品进行了初步的应用性试验.结果表明:34对引物中有4对无扩增产物,3对引物的扩增产物超过了设计范围,27对引物在供试的40个山核桃材料中有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中有18对引物的扩增产生了22个多态性位点,占总扩增位点数的47.8％.将SSR标记分析结果与山核桃已有的显性标记分析结果进行比较,发现SSR标记多态性位点的比例较高,且能够区分显性纯合位点及显性杂合位点.结论:设计开发山核桃的EST-SSR标记是可行有效的.
基于山覈桃Carya cathayensis脂肪代謝相關cDNA文庫的部分測序結果,髮現43條cDNA序列具有簡單重複序列(SSR)堿基重複特點,用Primer Premier 5設計瞭34對錶達序列標籤-簡單重複序列(EST-SSR)引物；建立瞭適用于山覈桃的SSR分析體繫,併用設計的SSR引物對對天然群體山覈桃40箇樣品進行瞭初步的應用性試驗.結果錶明:34對引物中有4對無擴增產物,3對引物的擴增產物超過瞭設計範圍,27對引物在供試的40箇山覈桃材料中有較清晰且穩定的目標擴增產物,其中有18對引物的擴增產生瞭22箇多態性位點,佔總擴增位點數的47.8％.將SSR標記分析結果與山覈桃已有的顯性標記分析結果進行比較,髮現SSR標記多態性位點的比例較高,且能夠區分顯性純閤位點及顯性雜閤位點.結論:設計開髮山覈桃的EST-SSR標記是可行有效的.
기우산핵도Carya cathayensis지방대사상관cDNA문고적부분측서결과,발현43조cDNA서렬구유간단중복서렬(SSR)감기중복특점,용Primer Premier 5설계료34대표체서렬표첨-간단중복서렬(EST-SSR)인물；건립료괄용우산핵도적SSR분석체계,병용설계적SSR인물대대천연군체산핵도40개양품진행료초보적응용성시험.결과표명:34대인물중유4대무확증산물,3대인물적확증산물초과료설계범위,27대인물재공시적40개산핵도재료중유교청석차은정적목표확증산물,기중유18대인물적확증산생료22개다태성위점,점총확증위점수적47.8％.장SSR표기분석결과여산핵도이유적현성표기분석결과진행비교,발현SSR표기다태성위점적비례교고,차능구구분현성순합위점급현성잡합위점.결론:설계개발산핵도적EST-SSR표기시가행유효적.
