台湾海峡
檯灣海峽
태만해협
JOURNAL OF OCEANOGRAPHY IN TAIWAN STRAIT
2011年
3期
357-362
,共6页
蒋霞敏%王佳%薛良义%曾建刚
蔣霞敏%王佳%薛良義%曾建剛
장하민%왕가%설량의%증건강
海洋生物学%曼氏无针乌贼%肌肉组织%cDNA文库%表达序列标签(ESTs)
海洋生物學%曼氏無針烏賊%肌肉組織%cDNA文庫%錶達序列標籤(ESTs)
해양생물학%만씨무침오적%기육조직%cDNA문고%표체서렬표첨(ESTs)
以曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)肌肉组织为研究材料,利用Clontech公司的cDNA文库构建试剂盒构建了曼氏无针乌贼肌肉cDNA文库.对文库质量的分析结果表明:cDNA文库的库容量约为1.2×106克隆(cfu/dm3),重组率达96％,插入片段平均长度大于1 000 bp.挑取568个阳性克隆进行5’末端测序,其中475条ESTs长度大于100 bp,初步拼接后得到200个单基因簇,包括41个重叠群和159个单拷贝EST,冗余度为57.89％.经检索,53条ESTs(占比为26.5％)在BLASTx上无明显的同源性(E值≥1.00×10 -10),为新基因.147条ESTs(占比为73.5％)与已报道的基因有较高的同源性；其中与能量相关基因的ESTs丰度最高,占总数的23.0％.细胞信号传导、细胞骨架和蛋白质代谢的次之,比例分别为17.5％、12.5％、9.5％,其中包括热激蛋白70、转铁蛋白等.这些EST数据有助于进一步筛选和克隆曼氏无针乌贼和其他头足动物的肌肉特异性表达基因.
以曼氏無針烏賊(Sepiella maindroni)肌肉組織為研究材料,利用Clontech公司的cDNA文庫構建試劑盒構建瞭曼氏無針烏賊肌肉cDNA文庫.對文庫質量的分析結果錶明:cDNA文庫的庫容量約為1.2×106剋隆(cfu/dm3),重組率達96％,插入片段平均長度大于1 000 bp.挑取568箇暘性剋隆進行5’末耑測序,其中475條ESTs長度大于100 bp,初步拼接後得到200箇單基因簇,包括41箇重疊群和159箇單拷貝EST,冗餘度為57.89％.經檢索,53條ESTs(佔比為26.5％)在BLASTx上無明顯的同源性(E值≥1.00×10 -10),為新基因.147條ESTs(佔比為73.5％)與已報道的基因有較高的同源性；其中與能量相關基因的ESTs豐度最高,佔總數的23.0％.細胞信號傳導、細胞骨架和蛋白質代謝的次之,比例分彆為17.5％、12.5％、9.5％,其中包括熱激蛋白70、轉鐵蛋白等.這些EST數據有助于進一步篩選和剋隆曼氏無針烏賊和其他頭足動物的肌肉特異性錶達基因.
이만씨무침오적(Sepiella maindroni)기육조직위연구재료,이용Clontech공사적cDNA문고구건시제합구건료만씨무침오적기육cDNA문고.대문고질량적분석결과표명:cDNA문고적고용량약위1.2×106극륭(cfu/dm3),중조솔체96％,삽입편단평균장도대우1 000 bp.도취568개양성극륭진행5’말단측서,기중475조ESTs장도대우100 bp,초보병접후득도200개단기인족,포괄41개중첩군화159개단고패EST,용여도위57.89％.경검색,53조ESTs(점비위26.5％)재BLASTx상무명현적동원성(E치≥1.00×10 -10),위신기인.147조ESTs(점비위73.5％)여이보도적기인유교고적동원성；기중여능량상관기인적ESTs봉도최고,점총수적23.0％.세포신호전도、세포골가화단백질대사적차지,비례분별위17.5％、12.5％、9.5％,기중포괄열격단백70、전철단백등.저사EST수거유조우진일보사선화극륭만씨무침오적화기타두족동물적기육특이성표체기인.
