西北农业学报
西北農業學報
서북농업학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-OCCIDENTALIS SINICA
2011年
11期
111-116
,共6页
李国琴%吉姣姣%巩振辉%黄炜%李大伟
李國琴%吉姣姣%鞏振輝%黃煒%李大偉
리국금%길교교%공진휘%황위%리대위
辣椒%CaCP26%基因克隆%分析
辣椒%CaCP26%基因剋隆%分析
랄초%CaCP26%기인극륭%분석
利用cDNA-AFLP方法,在辣椒雄性不育两用系的可育株花蕾与不育株花蕾获得阳性差异TDF(transcription derived fragment,转录衍生片段),通过电子克隆的方法获得大小为865 bp的cDNA序列,并在辣椒雄性不育两用系HW58可育株花蕾中进行RT-PCR验证,测序结果与电子克隆结果的一致性高达99.61%.经Blast N比对,所克隆基因与烟草 CP26 基因序列的同源性高达90%,命名为 CaCP26 (GenBank登录号为GQ999612).该基因871 bp,包含一个864 bp的开放阅读框,编码287个氨基酸,所编码的蛋白质为疏水蛋白,分子质量30 710.47 u,理论等电点为5.807,有跨膜域,无信号肽,二级结构以无规则卷曲为主;利用Swiss-model得到CaCP26蛋白(65~285aa)的三级结构;系统进化树结果显示,辣椒 CaCP26 与烟草 CP26的亲缘关系最近.半定量RT-PCR分析表明,CaCP26 在小孢子单核期的辣椒雄性不育两用系可育株的相对表达量是不育株花蕾相对表达量的6.58倍.
利用cDNA-AFLP方法,在辣椒雄性不育兩用繫的可育株花蕾與不育株花蕾穫得暘性差異TDF(transcription derived fragment,轉錄衍生片段),通過電子剋隆的方法穫得大小為865 bp的cDNA序列,併在辣椒雄性不育兩用繫HW58可育株花蕾中進行RT-PCR驗證,測序結果與電子剋隆結果的一緻性高達99.61%.經Blast N比對,所剋隆基因與煙草 CP26 基因序列的同源性高達90%,命名為 CaCP26 (GenBank登錄號為GQ999612).該基因871 bp,包含一箇864 bp的開放閱讀框,編碼287箇氨基痠,所編碼的蛋白質為疏水蛋白,分子質量30 710.47 u,理論等電點為5.807,有跨膜域,無信號肽,二級結構以無規則捲麯為主;利用Swiss-model得到CaCP26蛋白(65~285aa)的三級結構;繫統進化樹結果顯示,辣椒 CaCP26 與煙草 CP26的親緣關繫最近.半定量RT-PCR分析錶明,CaCP26 在小孢子單覈期的辣椒雄性不育兩用繫可育株的相對錶達量是不育株花蕾相對錶達量的6.58倍.
이용cDNA-AFLP방법,재랄초웅성불육량용계적가육주화뢰여불육주화뢰획득양성차이TDF(transcription derived fragment,전록연생편단),통과전자극륭적방법획득대소위865 bp적cDNA서렬,병재랄초웅성불육량용계HW58가육주화뢰중진행RT-PCR험증,측서결과여전자극륭결과적일치성고체99.61%.경Blast N비대,소극륭기인여연초 CP26 기인서렬적동원성고체90%,명명위 CaCP26 (GenBank등록호위GQ999612).해기인871 bp,포함일개864 bp적개방열독광,편마287개안기산,소편마적단백질위소수단백,분자질량30 710.47 u,이론등전점위5.807,유과막역,무신호태,이급결구이무규칙권곡위주;이용Swiss-model득도CaCP26단백(65~285aa)적삼급결구;계통진화수결과현시,랄초 CaCP26 여연초 CP26적친연관계최근.반정량RT-PCR분석표명,CaCP26 재소포자단핵기적랄초웅성불육량용계가육주적상대표체량시불육주화뢰상대표체량적6.58배.