计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2011年
5期
523-526
,共4页
杨辉华%李灵巧%覃炳达%梁琼麟%王义明%罗国安
楊輝華%李靈巧%覃炳達%樑瓊麟%王義明%囉國安
양휘화%리령교%담병체%량경린%왕의명%라국안
CloudChem%化学计量学软件%云计算%软件即服务%并行计算
CloudChem%化學計量學軟件%雲計算%軟件即服務%併行計算
CloudChem%화학계량학연건%운계산%연건즉복무%병행계산
化学计量学被广泛应用于光谱、色谱及质谱数据处理,现有化学计量学软件都为串行单机程序,这将导致程序开发成本高、部署升级困难、可控制性差等缺点,难以胜任分析数据的成倍增长对快速分析和有效管理带来巨大的挑战.为了解决这些缺点,本文提出了CloudChem——1种基于云计算的化学计量学软件服务,它采用软件即服务的模式,使用浏览器/服务器结构来提供专业的化学计量学软件服务.系统的服务器端分为工作流层、业务层、计算层、数据层和Web层.数据层综合利用关系型数据库和分布式文件系统2种方法的优势来存储和组织数据;计算层使用并行计算来提升数据处理速度和规模;Web层使用Open API实现平台的数据资源共享功能.实验表明,平台上的并行交叉验证框架在四核CPU上加速比可以达到3.763倍.所以,CloudChem可以较好克服传统化学计量学软件的缺点,基于该方法的软件服务平台可实现光谱、色谱、核磁、质谱等数据的有效、高速、一体化的存储、分析、挖掘,最大限度减小用户在使用化学计量软件的基础设施成本和软件成本.
化學計量學被廣汎應用于光譜、色譜及質譜數據處理,現有化學計量學軟件都為串行單機程序,這將導緻程序開髮成本高、部署升級睏難、可控製性差等缺點,難以勝任分析數據的成倍增長對快速分析和有效管理帶來巨大的挑戰.為瞭解決這些缺點,本文提齣瞭CloudChem——1種基于雲計算的化學計量學軟件服務,它採用軟件即服務的模式,使用瀏覽器/服務器結構來提供專業的化學計量學軟件服務.繫統的服務器耑分為工作流層、業務層、計算層、數據層和Web層.數據層綜閤利用關繫型數據庫和分佈式文件繫統2種方法的優勢來存儲和組織數據;計算層使用併行計算來提升數據處理速度和規模;Web層使用Open API實現平檯的數據資源共享功能.實驗錶明,平檯上的併行交扠驗證框架在四覈CPU上加速比可以達到3.763倍.所以,CloudChem可以較好剋服傳統化學計量學軟件的缺點,基于該方法的軟件服務平檯可實現光譜、色譜、覈磁、質譜等數據的有效、高速、一體化的存儲、分析、挖掘,最大限度減小用戶在使用化學計量軟件的基礎設施成本和軟件成本.
화학계량학피엄범응용우광보、색보급질보수거처리,현유화학계량학연건도위천행단궤정서,저장도치정서개발성본고、부서승급곤난、가공제성차등결점,난이성임분석수거적성배증장대쾌속분석화유효관리대래거대적도전.위료해결저사결점,본문제출료CloudChem——1충기우운계산적화학계량학연건복무,타채용연건즉복무적모식,사용류람기/복무기결구래제공전업적화학계량학연건복무.계통적복무기단분위공작류층、업무층、계산층、수거층화Web층.수거층종합이용관계형수거고화분포식문건계통2충방법적우세래존저화조직수거;계산층사용병행계산래제승수거처리속도화규모;Web층사용Open API실현평태적수거자원공향공능.실험표명,평태상적병행교차험증광가재사핵CPU상가속비가이체도3.763배.소이,CloudChem가이교호극복전통화학계량학연건적결점,기우해방법적연건복무평태가실현광보、색보、핵자、질보등수거적유효、고속、일체화적존저、분석、알굴,최대한도감소용호재사용화학계량연건적기출설시성본화연건성본.