实用预防医学
實用預防醫學
실용예방의학
PRACTICAL PREVENTIVE MEDICINE
2011年
4期
594-597
,共4页
魏中南%王维鹏%胡洪波%彭巧英%胡兴文
魏中南%王維鵬%鬍洪波%彭巧英%鬍興文
위중남%왕유붕%호홍파%팽교영%호흥문
人巨细胞病毒%UL144基因%CTL表位
人巨細胞病毒%UL144基因%CTL錶位
인거세포병독%UL144기인%CTL표위
目的 了解引起新生儿晚期黄疸的人巨细胞病毒(HCMV)UL144基因多态性,预测UL144基因各型编码蛋白的T细胞CTL表位.方法 应用荧光定量PCR法检测晚期黄疽新生儿标本HCMV-DNA含量,采用巢式聚合酶链反应扩增阳性标本HCMV UL144基因开放读码框(ORF),结果进行双向DNA测序,绘制种系进化树对HCMV感染患儿UL144基因进行分型.应用SYFPEITHI和NetCTL方案预测HCMV UL144基因编码蛋白各临床株T细胞CTL表位.结果①30例晚期黄疸新生儿荧光定量PCR检测阳性,其中28例UL144基因扩增阳性.②28株UL144基因与Toledo株进行同源性比较,核苷酸水平为80.4%~99.2%,氨基酸水平为78.9%~98.8%.种系进化树分析显示感染患儿标本UL144基因可分为3个基因型,G1型7株(25%),其中G1a3株,G1b3株,G1c1株,G2型7株(25%),G3型14株(50%),③初步筛选出UL144基因各型T细胞CTL表位:G1a:YTYFSTPGV或HTYFSTPGV;G1b:HTYFSTPGV;G1c:YTSFSISGV;G2:TLCPNGTYL或TLCPNGTYL和HTLFSTPGV;G3:TLCPNGTYV.结论 ①HCMV UL144基因的DNA序列具有高度多态性,晚期黄疸新生儿中HCMV感染以G3型为主.②各型编码蛋白的T细胞CTL表位存在差异.
目的 瞭解引起新生兒晚期黃疸的人巨細胞病毒(HCMV)UL144基因多態性,預測UL144基因各型編碼蛋白的T細胞CTL錶位.方法 應用熒光定量PCR法檢測晚期黃疽新生兒標本HCMV-DNA含量,採用巢式聚閤酶鏈反應擴增暘性標本HCMV UL144基因開放讀碼框(ORF),結果進行雙嚮DNA測序,繪製種繫進化樹對HCMV感染患兒UL144基因進行分型.應用SYFPEITHI和NetCTL方案預測HCMV UL144基因編碼蛋白各臨床株T細胞CTL錶位.結果①30例晚期黃疸新生兒熒光定量PCR檢測暘性,其中28例UL144基因擴增暘性.②28株UL144基因與Toledo株進行同源性比較,覈苷痠水平為80.4%~99.2%,氨基痠水平為78.9%~98.8%.種繫進化樹分析顯示感染患兒標本UL144基因可分為3箇基因型,G1型7株(25%),其中G1a3株,G1b3株,G1c1株,G2型7株(25%),G3型14株(50%),③初步篩選齣UL144基因各型T細胞CTL錶位:G1a:YTYFSTPGV或HTYFSTPGV;G1b:HTYFSTPGV;G1c:YTSFSISGV;G2:TLCPNGTYL或TLCPNGTYL和HTLFSTPGV;G3:TLCPNGTYV.結論 ①HCMV UL144基因的DNA序列具有高度多態性,晚期黃疸新生兒中HCMV感染以G3型為主.②各型編碼蛋白的T細胞CTL錶位存在差異.
목적 료해인기신생인만기황달적인거세포병독(HCMV)UL144기인다태성,예측UL144기인각형편마단백적T세포CTL표위.방법 응용형광정량PCR법검측만기황저신생인표본HCMV-DNA함량,채용소식취합매련반응확증양성표본HCMV UL144기인개방독마광(ORF),결과진행쌍향DNA측서,회제충계진화수대HCMV감염환인UL144기인진행분형.응용SYFPEITHI화NetCTL방안예측HCMV UL144기인편마단백각림상주T세포CTL표위.결과①30례만기황달신생인형광정량PCR검측양성,기중28례UL144기인확증양성.②28주UL144기인여Toledo주진행동원성비교,핵감산수평위80.4%~99.2%,안기산수평위78.9%~98.8%.충계진화수분석현시감염환인표본UL144기인가분위3개기인형,G1형7주(25%),기중G1a3주,G1b3주,G1c1주,G2형7주(25%),G3형14주(50%),③초보사선출UL144기인각형T세포CTL표위:G1a:YTYFSTPGV혹HTYFSTPGV;G1b:HTYFSTPGV;G1c:YTSFSISGV;G2:TLCPNGTYL혹TLCPNGTYL화HTLFSTPGV;G3:TLCPNGTYV.결론 ①HCMV UL144기인적DNA서렬구유고도다태성,만기황달신생인중HCMV감염이G3형위주.②각형편마단백적T세포CTL표위존재차이.