中国病理生理杂志
中國病理生理雜誌
중국병리생리잡지
CHINESE JOURNAL OF PATHOPHYSIOLOGY
2009年
1期
205-208
,共4页
李菊玲%曾耀英%季煜华%杜彬
李菊玲%曾耀英%季煜華%杜彬
리국령%증요영%계욱화%두빈
nanoLC-ESI/MS/MS技术%ECV304细胞%蛋白质组
nanoLC-ESI/MS/MS技術%ECV304細胞%蛋白質組
nanoLC-ESI/MS/MS기술%ECV304세포%단백질조
目的:应用纳升液联用技术(nanoLC-ESI/MS/MS)对ECV304细胞蛋白质组学进行初步分析.方法:提取ECV304细胞总蛋白,经变性、还原、烷基化和酶解,nanoLC-ESI/MS/MS对酶解后的肽段进行分析,数据库(Swissprot)检索鉴定蛋白质,生物信息学工具对所鉴定的蛋白质进行细胞定位和功能分类.结果:从8μg 细胞总蛋白中鉴定了120种蛋白质,所鉴定蛋白质的分子质量(MW)范围从6648 D至280 739 D,MW<20 kD的蛋白质占24.2%,MW>100 kD的蛋白质占5.0%;主要位于细胞质、细胞骨架、细胞核和细胞膜,分别为27.8%、19.0%、15.2%和10.1%;大多为结构蛋白质和催化活性的蛋白质,分别为36.4%和34.1%,具有信号转导活性的占11.4%;其中角蛋白8、18和vimentin等为内皮细胞特异表达的蛋白质.结论:本研究建立了nanoLC-ESI/MS/Ms分析ECV304细胞的蛋白质组学方法,为内皮细胞及内皮细胞损伤机制的蛋白质组学研究奠定了实验基础.
目的:應用納升液聯用技術(nanoLC-ESI/MS/MS)對ECV304細胞蛋白質組學進行初步分析.方法:提取ECV304細胞總蛋白,經變性、還原、烷基化和酶解,nanoLC-ESI/MS/MS對酶解後的肽段進行分析,數據庫(Swissprot)檢索鑒定蛋白質,生物信息學工具對所鑒定的蛋白質進行細胞定位和功能分類.結果:從8μg 細胞總蛋白中鑒定瞭120種蛋白質,所鑒定蛋白質的分子質量(MW)範圍從6648 D至280 739 D,MW<20 kD的蛋白質佔24.2%,MW>100 kD的蛋白質佔5.0%;主要位于細胞質、細胞骨架、細胞覈和細胞膜,分彆為27.8%、19.0%、15.2%和10.1%;大多為結構蛋白質和催化活性的蛋白質,分彆為36.4%和34.1%,具有信號轉導活性的佔11.4%;其中角蛋白8、18和vimentin等為內皮細胞特異錶達的蛋白質.結論:本研究建立瞭nanoLC-ESI/MS/Ms分析ECV304細胞的蛋白質組學方法,為內皮細胞及內皮細胞損傷機製的蛋白質組學研究奠定瞭實驗基礎.
목적:응용납승액련용기술(nanoLC-ESI/MS/MS)대ECV304세포단백질조학진행초보분석.방법:제취ECV304세포총단백,경변성、환원、완기화화매해,nanoLC-ESI/MS/MS대매해후적태단진행분석,수거고(Swissprot)검색감정단백질,생물신식학공구대소감정적단백질진행세포정위화공능분류.결과:종8μg 세포총단백중감정료120충단백질,소감정단백질적분자질량(MW)범위종6648 D지280 739 D,MW<20 kD적단백질점24.2%,MW>100 kD적단백질점5.0%;주요위우세포질、세포골가、세포핵화세포막,분별위27.8%、19.0%、15.2%화10.1%;대다위결구단백질화최화활성적단백질,분별위36.4%화34.1%,구유신호전도활성적점11.4%;기중각단백8、18화vimentin등위내피세포특이표체적단백질.결론:본연구건립료nanoLC-ESI/MS/Ms분석ECV304세포적단백질조학방법,위내피세포급내피세포손상궤제적단백질조학연구전정료실험기출.
