畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2009年
3期
394-401
,共8页
徐怀英%秦卓明%王友令%欧阳文军%谭雷涛%何叶峰%金维江%袁小远
徐懷英%秦卓明%王友令%歐暘文軍%譚雷濤%何葉峰%金維江%袁小遠
서부영%진탁명%왕우령%구양문군%담뢰도%하협봉%금유강%원소원
新城疫病毒%F基因%HN基因%同源性%遗传变异%相关性
新城疫病毒%F基因%HN基因%同源性%遺傳變異%相關性
신성역병독%F기인%HN기인%동원성%유전변이%상관성
选取中国1996-2005年的8株鹅、鸭等水禽NDV流行株,克隆其融合蛋白(F)和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因,参考GenBank中具有F和HN核苷酸全长的16株国内外NDV代表株、16株国内水禽流行株以及12株只具有F基因的水禽毒株序列,参照传统F基因分型方法,分别对F和HN基因进行分型,同时进行相关比较、核苷酸和氨基酸同源性以及系统发育分析.结果表明;16株国内外代表株F和HN基因分型基本一致,但24株水禽NDV流行株中只有15株相同,符合率为62.5%,不同占37.5%(9/24).系统发育和同源比较发现:水禽NDV流行株HN基因高度同源,同属Ⅶ型,而F基因则分属不同的基因型.通过对24株NDV F和HN基因氨基酸全长以及进行F基因分型的F基因47-420位核苷酸的同源性相关性比较证实:F基因前47-420位核苷酸的遗传变异与F基因氨基酸全长变异密切相关,r=0.916,但与HN基因的氨基酸变异不相关,显示出NDV在演变过程中F和HN基因具有相对的独立性.水禽NDV是家禽NDV的重要储存宿主,应高度重视水禽NDV的变异.
選取中國1996-2005年的8株鵝、鴨等水禽NDV流行株,剋隆其融閤蛋白(F)和血凝素-神經氨痠酶(HN)基因,參攷GenBank中具有F和HN覈苷痠全長的16株國內外NDV代錶株、16株國內水禽流行株以及12株隻具有F基因的水禽毒株序列,參照傳統F基因分型方法,分彆對F和HN基因進行分型,同時進行相關比較、覈苷痠和氨基痠同源性以及繫統髮育分析.結果錶明;16株國內外代錶株F和HN基因分型基本一緻,但24株水禽NDV流行株中隻有15株相同,符閤率為62.5%,不同佔37.5%(9/24).繫統髮育和同源比較髮現:水禽NDV流行株HN基因高度同源,同屬Ⅶ型,而F基因則分屬不同的基因型.通過對24株NDV F和HN基因氨基痠全長以及進行F基因分型的F基因47-420位覈苷痠的同源性相關性比較證實:F基因前47-420位覈苷痠的遺傳變異與F基因氨基痠全長變異密切相關,r=0.916,但與HN基因的氨基痠變異不相關,顯示齣NDV在縯變過程中F和HN基因具有相對的獨立性.水禽NDV是傢禽NDV的重要儲存宿主,應高度重視水禽NDV的變異.
선취중국1996-2005년적8주아、압등수금NDV류행주,극륭기융합단백(F)화혈응소-신경안산매(HN)기인,삼고GenBank중구유F화HN핵감산전장적16주국내외NDV대표주、16주국내수금류행주이급12주지구유F기인적수금독주서렬,삼조전통F기인분형방법,분별대F화HN기인진행분형,동시진행상관비교、핵감산화안기산동원성이급계통발육분석.결과표명;16주국내외대표주F화HN기인분형기본일치,단24주수금NDV류행주중지유15주상동,부합솔위62.5%,불동점37.5%(9/24).계통발육화동원비교발현:수금NDV류행주HN기인고도동원,동속Ⅶ형,이F기인칙분속불동적기인형.통과대24주NDV F화HN기인안기산전장이급진행F기인분형적F기인47-420위핵감산적동원성상관성비교증실:F기인전47-420위핵감산적유전변이여F기인안기산전장변이밀절상관,r=0.916,단여HN기인적안기산변이불상관,현시출NDV재연변과정중F화HN기인구유상대적독립성.수금NDV시가금NDV적중요저존숙주,응고도중시수금NDV적변이.
