基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2011年
4期
352-358
,共7页
张子宇%赵帅%莫伟兰%罗雪梅%玉延华%段承杰%冯家勋
張子宇%趙帥%莫偉蘭%囉雪梅%玉延華%段承傑%馮傢勛
장자우%조수%막위란%라설매%옥연화%단승걸%풍가훈
水稻白叶枯病菌%三型分泌系统%基因组文库%avrBs3/pthA家族基因
水稻白葉枯病菌%三型分泌繫統%基因組文庫%avrBs3/pthA傢族基因
수도백협고병균%삼형분비계통%기인조문고%avrBs3/pthA가족기인
由革兰氏阴性细菌水稻白叶枯病菌引起的水稻白叶枯病是亚洲、北美以及非洲部分地区最严重的水稻病害之一,水稻白叶枯病可使水稻减产高达50%以上.研究表明水稻白叶枯病菌的毒力主要依靠三型分泌系统所分泌的效应物.为了解水稻白叶枯病菌广西菌株GX1329中含有avrBs3/pthA家族基因的情况,本研究应用AluⅠ部分酶切其基因组DNA,构建了含有736个克隆的菌株GX1329的基因组文库.BamHⅠ酶切分析随机挑取的15个文库克隆表明,克隆的外源DNA随机性良好,克隆的最小片段为27.7 kb,最大为58.5 kb,平均大小为39.9 kb,文库克隆容量约为2.8×103 Mb,该文库中包含基因组中任一个基因的概率为99.4%.利用来自水稻白叶枯病菌菲律宾菌株PXO86的无毒基因avrXa10的第252位~第486位核苷酸序列作为探针,通过菌落原位杂交从GX1329基因组文库中筛选到37个含avrBs3/pthA家族基因的克隆.再通过Southern杂交分析,得到了17个独立克隆.这17个克隆中至少含有13个不同的avrBs3/pthA家族基因.这些基因在GX1329基因组中有的单独存在,有的两个或两个以上串联存在.本工作基本上明确了菌株GX1329基因组中avrBs3/pthA家族基因的数量,为进一步研究菌株GX1329中avrBs3/pthA家族基因的功能奠定了基础.
由革蘭氏陰性細菌水稻白葉枯病菌引起的水稻白葉枯病是亞洲、北美以及非洲部分地區最嚴重的水稻病害之一,水稻白葉枯病可使水稻減產高達50%以上.研究錶明水稻白葉枯病菌的毒力主要依靠三型分泌繫統所分泌的效應物.為瞭解水稻白葉枯病菌廣西菌株GX1329中含有avrBs3/pthA傢族基因的情況,本研究應用AluⅠ部分酶切其基因組DNA,構建瞭含有736箇剋隆的菌株GX1329的基因組文庫.BamHⅠ酶切分析隨機挑取的15箇文庫剋隆錶明,剋隆的外源DNA隨機性良好,剋隆的最小片段為27.7 kb,最大為58.5 kb,平均大小為39.9 kb,文庫剋隆容量約為2.8×103 Mb,該文庫中包含基因組中任一箇基因的概率為99.4%.利用來自水稻白葉枯病菌菲律賓菌株PXO86的無毒基因avrXa10的第252位~第486位覈苷痠序列作為探針,通過菌落原位雜交從GX1329基因組文庫中篩選到37箇含avrBs3/pthA傢族基因的剋隆.再通過Southern雜交分析,得到瞭17箇獨立剋隆.這17箇剋隆中至少含有13箇不同的avrBs3/pthA傢族基因.這些基因在GX1329基因組中有的單獨存在,有的兩箇或兩箇以上串聯存在.本工作基本上明確瞭菌株GX1329基因組中avrBs3/pthA傢族基因的數量,為進一步研究菌株GX1329中avrBs3/pthA傢族基因的功能奠定瞭基礎.
유혁란씨음성세균수도백협고병균인기적수도백협고병시아주、북미이급비주부분지구최엄중적수도병해지일,수도백협고병가사수도감산고체50%이상.연구표명수도백협고병균적독력주요의고삼형분비계통소분비적효응물.위료해수도백협고병균엄서균주GX1329중함유avrBs3/pthA가족기인적정황,본연구응용AluⅠ부분매절기기인조DNA,구건료함유736개극륭적균주GX1329적기인조문고.BamHⅠ매절분석수궤도취적15개문고극륭표명,극륭적외원DNA수궤성량호,극륭적최소편단위27.7 kb,최대위58.5 kb,평균대소위39.9 kb,문고극륭용량약위2.8×103 Mb,해문고중포함기인조중임일개기인적개솔위99.4%.이용래자수도백협고병균비률빈균주PXO86적무독기인avrXa10적제252위~제486위핵감산서렬작위탐침,통과균락원위잡교종GX1329기인조문고중사선도37개함avrBs3/pthA가족기인적극륭.재통과Southern잡교분석,득도료17개독립극륭.저17개극륭중지소함유13개불동적avrBs3/pthA가족기인.저사기인재GX1329기인조중유적단독존재,유적량개혹량개이상천련존재.본공작기본상명학료균주GX1329기인조중avrBs3/pthA가족기인적수량,위진일보연구균주GX1329중avrBs3/pthA가족기인적공능전정료기출.
