热带医学杂志
熱帶醫學雜誌
열대의학잡지
JOURNAL OF TROPICAL MEDICINE
2008年
4期
291-294
,共4页
廖之君%马文丽%梁爽%陈霞%商涛%董云巧%郑文岭
廖之君%馬文麗%樑爽%陳霞%商濤%董雲巧%鄭文嶺
료지군%마문려%량상%진하%상도%동운교%정문령
电离辐射%细胞凋亡%转录因子%转录因子结合位点%转录调控网络
電離輻射%細胞凋亡%轉錄因子%轉錄因子結閤位點%轉錄調控網絡
전리복사%세포조망%전록인자%전록인자결합위점%전록조공망락
目的 探讨电离辐射影响人成纤维细胞基因表达的转录调控机制,并构建基因与相应转录因子的调控网络.方法 先对前期研究已经获得的差异表达基因进行功能注释,选择结合功能类基因(数量最多)进人研究:再用MaxLAPS,TFME和SCOPE 3种软件预测这些基因的转录因子和转录因子结合位点;利用Bibliosphere软件构建转录因子与基因的转录调控网络.结果 获得25条Gene Symbols,基因本体功能注释集中于结合功能(共19条),2种程序预测得到14个相同的转录因子,得分最高的6个转录因子结合位点对应的转录因子与预测的基本一致.按照最高水平标准构建的转录调控网络,显示CASPASE-3位于网络的核心.结论 电离辐射很可能经转录因子TP53介导CASPASE-3激活而致人成纤维细胞凋亡.
目的 探討電離輻射影響人成纖維細胞基因錶達的轉錄調控機製,併構建基因與相應轉錄因子的調控網絡.方法 先對前期研究已經穫得的差異錶達基因進行功能註釋,選擇結閤功能類基因(數量最多)進人研究:再用MaxLAPS,TFME和SCOPE 3種軟件預測這些基因的轉錄因子和轉錄因子結閤位點;利用Bibliosphere軟件構建轉錄因子與基因的轉錄調控網絡.結果 穫得25條Gene Symbols,基因本體功能註釋集中于結閤功能(共19條),2種程序預測得到14箇相同的轉錄因子,得分最高的6箇轉錄因子結閤位點對應的轉錄因子與預測的基本一緻.按照最高水平標準構建的轉錄調控網絡,顯示CASPASE-3位于網絡的覈心.結論 電離輻射很可能經轉錄因子TP53介導CASPASE-3激活而緻人成纖維細胞凋亡.
목적 탐토전리복사영향인성섬유세포기인표체적전록조공궤제,병구건기인여상응전록인자적조공망락.방법 선대전기연구이경획득적차이표체기인진행공능주석,선택결합공능류기인(수량최다)진인연구:재용MaxLAPS,TFME화SCOPE 3충연건예측저사기인적전록인자화전록인자결합위점;이용Bibliosphere연건구건전록인자여기인적전록조공망락.결과 획득25조Gene Symbols,기인본체공능주석집중우결합공능(공19조),2충정서예측득도14개상동적전록인자,득분최고적6개전록인자결합위점대응적전록인자여예측적기본일치.안조최고수평표준구건적전록조공망락,현시CASPASE-3위우망락적핵심.결론 전리복사흔가능경전록인자TP53개도CASPASE-3격활이치인성섬유세포조망.
