CAJ | 학술논문

将本实验室分离到的山羊痘病毒云南流行毒株MYS、XW、XD及疫苗株VF4主要结构蛋白基因P32基因克隆到PMD18T载体后进行双向测序,所得序列与Genbank中羊痘病毒属成员:山羊痘病毒(GTPV)、绵羊痘病毒(SPPV)、疙瘩皮肤病病毒(SLDV)参考毒株相应序列作对比分析(By ClustalW Method),结果显示:(1)MYS、XD毒株P32基因全长969 bp,疫苗株VF4为974 bp,XW毒株为975 bp.(2)XW、疫苗株VF4在100～105 bp位置处均插入6个A,在947 bp位置缺失一个T;SPPV参考毒株在169～171 bp位置插入GAT.(3)由于疫苗株VF4 P32基因核苷酸序列第414位置处发生了T/A突变,在该处形成一个新的终止密码子TAA,导致完整的开放读码框架(ORF)被打断,只表达第1～411 bp(137个Aa)的基因片段,而不能表达出完整的P32蛋白.其余6株毒株的开放读码框架均很相似.(4)在所构建的系统发生树中,LSDV与SPPV参考毒株、MYS和XD株、VF4和XW株、GTPV参考毒株各被划分为一组.所有7个毒株P32基因核苷酸序列的同源性都很高,均在97%以上.其中疫苗株VF4与SPPV参考毒株的同源性最低,为97.6%.XD与XW毒株的同源性最高,为99.8%.(5)酶切位点分析结果显示,MYS、XW、XD、VF4及GTPV和SLDV参考毒株具有唯一的Hinf I酶切位点,大约在第694 bp位置.SPPV参考毒株具有2个Hinf I酶切位点,分别在第391 bp和691 bp位置处,该酶切位点较适合用来鉴别山羊痘和绵羊痘病毒,而疙瘩皮肤病在临床上就很容易与山羊痘和绵羊痘鉴别开来.
장본실험실분리도적산양두병독운남류행독주MYS、XW、XD급역묘주VF4주요결구단백기인P32기인극륭도PMD18T재체후진행쌍향측서,소득서렬여Genbank중양두병독속성원:산양두병독(GTPV)、면양두병독(SPPV)、흘탑피부병병독(SLDV)삼고독주상응서렬작대비분석(By ClustalW Method),결과현시:(1)MYS、XD독주P32기인전장969 bp,역묘주VF4위974 bp,XW독주위975 bp.(2)XW、역묘주VF4재100～105 bp위치처균삽입6개A,재947 bp위치결실일개T;SPPV삼고독주재169～171 bp위치삽입GAT.(3)유우역묘주VF4 P32기인핵감산서렬제414위치처발생료T/A돌변,재해처형성일개신적종지밀마자TAA,도치완정적개방독마광가(ORF)피타단,지표체제1～411 bp(137개Aa)적기인편단,이불능표체출완정적P32단백.기여6주독주적개방독마광가균흔상사.(4)재소구건적계통발생수중,LSDV여SPPV삼고독주、MYS화XD주、VF4화XW주、GTPV삼고독주각피화분위일조.소유7개독주P32기인핵감산서렬적동원성도흔고,균재97%이상.기중역묘주VF4여SPPV삼고독주적동원성최저,위97.6%.XD여XW독주적동원성최고,위99.8%.(5)매절위점분석결과현시,MYS、XW、XD、VF4급GTPV화SLDV삼고독주구유유일적Hinf I매절위점,대약재제694 bp위치.SPPV삼고독주구유2개Hinf I매절위점,분별재제391 bp화691 bp위치처,해매절위점교괄합용래감별산양두화면양두병독,이흘탑피부병재림상상취흔용역여산양두화면양두감별개래.