高分子学报
高分子學報
고분자학보
ACTA POLYMERICA SINICA
2003年
2期
171-174
,共4页
陈进%李靖%章林溪%姜舟婷%夏阿根%叶高翔%赵得禄
陳進%李靖%章林溪%薑舟婷%夏阿根%葉高翔%趙得祿
진진%리정%장림계%강주정%하아근%협고상%조득록
球状蛋白质%紧密接触对%CSU软件%折叠
毬狀蛋白質%緊密接觸對%CSU軟件%摺疊
구상단백질%긴밀접촉대%CSU연건%절첩
采用CSU软件(Contacts of structural units),对61种球状蛋白质分子中氨基酸紧密接触对(Residue-residue contact)进行了研究.重点研究了不同氨基酸在形成远程紧密接触对(Long-range contact)和近程紧密接触对(Short-range contact)时的不同能力.发现氨基酸Leu,Val,Ile,Met,Phe,Tyr,Cys,Trp(疏性氨基酸,H)比较容易形成远程紧密接触对,氨基酸Glu,Gln,Asp,Asn,Lys,Ser,Arg,Pro(亲水氨基酸,P)比较难形成远程紧密接触对,而氨基酸Ala,Gly,Thr,His(中性氨基酸,N)在形成远程紧密接触对时能力一般.它们平均每个氨基酸可形成6.03,3.64和4.43个远程紧密接触对.同时它们在形成近程紧密接触对时能力非常接近,平均每个氨基酸可形成的近程紧密接触对数目在2.34～2.85变化,差别非常小.亲水氨基酸(P),中性氨基酸(N)和疏水性氨基酸(H)在蛋白质分子结构稳定性上起着不同的作用.
採用CSU軟件(Contacts of structural units),對61種毬狀蛋白質分子中氨基痠緊密接觸對(Residue-residue contact)進行瞭研究.重點研究瞭不同氨基痠在形成遠程緊密接觸對(Long-range contact)和近程緊密接觸對(Short-range contact)時的不同能力.髮現氨基痠Leu,Val,Ile,Met,Phe,Tyr,Cys,Trp(疏性氨基痠,H)比較容易形成遠程緊密接觸對,氨基痠Glu,Gln,Asp,Asn,Lys,Ser,Arg,Pro(親水氨基痠,P)比較難形成遠程緊密接觸對,而氨基痠Ala,Gly,Thr,His(中性氨基痠,N)在形成遠程緊密接觸對時能力一般.它們平均每箇氨基痠可形成6.03,3.64和4.43箇遠程緊密接觸對.同時它們在形成近程緊密接觸對時能力非常接近,平均每箇氨基痠可形成的近程緊密接觸對數目在2.34～2.85變化,差彆非常小.親水氨基痠(P),中性氨基痠(N)和疏水性氨基痠(H)在蛋白質分子結構穩定性上起著不同的作用.
채용CSU연건(Contacts of structural units),대61충구상단백질분자중안기산긴밀접촉대(Residue-residue contact)진행료연구.중점연구료불동안기산재형성원정긴밀접촉대(Long-range contact)화근정긴밀접촉대(Short-range contact)시적불동능력.발현안기산Leu,Val,Ile,Met,Phe,Tyr,Cys,Trp(소성안기산,H)비교용역형성원정긴밀접촉대,안기산Glu,Gln,Asp,Asn,Lys,Ser,Arg,Pro(친수안기산,P)비교난형성원정긴밀접촉대,이안기산Ala,Gly,Thr,His(중성안기산,N)재형성원정긴밀접촉대시능력일반.타문평균매개안기산가형성6.03,3.64화4.43개원정긴밀접촉대.동시타문재형성근정긴밀접촉대시능력비상접근,평균매개안기산가형성적근정긴밀접촉대수목재2.34～2.85변화,차별비상소.친수안기산(P),중성안기산(N)화소수성안기산(H)재단백질분자결구은정성상기착불동적작용.
