物理学报
物理學報
물이학보
2002年
11期
2440-2445
,共6页
赵明文%夏曰源%马玉臣%刘向东%英敏菊
趙明文%夏曰源%馬玉臣%劉嚮東%英敏菊
조명문%하왈원%마옥신%류향동%영민국
冻结密度近似%氢键%密度泛函
凍結密度近似%氫鍵%密度汎函
동결밀도근사%경건%밀도범함
为计算相互作用较弱的分子碎片之间的耦合能,Harris 从密度泛函理论出发,提出了一种简化方法,即冻结密度近似(FDA)方法.对该方法在描述分子间氢键作用的合理性进行了验证.对水分子间的HO┉H氢键、甲酰胺与水分子间的NH┉O氢键、二氟甲烷和水分子间的OH┉F氢键,以及DNA中的碱基(AT,GC)之间的N-H┉O,N-H┉N等类型的氢键的计算表明:若电子交换关联采用非定域自旋密度近似,FDA的计算结果同其他ab initio方法的计算结果以及实验结果都符合得很好.FDA在计算过程中既不需要求解泊松方程,也不需要进行反复的自洽迭代,所以运算速度较快,在研究生物大分子体系中的氢键相互作用方面具有一定的使用价值.
為計算相互作用較弱的分子碎片之間的耦閤能,Harris 從密度汎函理論齣髮,提齣瞭一種簡化方法,即凍結密度近似(FDA)方法.對該方法在描述分子間氫鍵作用的閤理性進行瞭驗證.對水分子間的HO┉H氫鍵、甲酰胺與水分子間的NH┉O氫鍵、二氟甲烷和水分子間的OH┉F氫鍵,以及DNA中的堿基(AT,GC)之間的N-H┉O,N-H┉N等類型的氫鍵的計算錶明:若電子交換關聯採用非定域自鏇密度近似,FDA的計算結果同其他ab initio方法的計算結果以及實驗結果都符閤得很好.FDA在計算過程中既不需要求解泊鬆方程,也不需要進行反複的自洽迭代,所以運算速度較快,在研究生物大分子體繫中的氫鍵相互作用方麵具有一定的使用價值.
위계산상호작용교약적분자쇄편지간적우합능,Harris 종밀도범함이론출발,제출료일충간화방법,즉동결밀도근사(FDA)방법.대해방법재묘술분자간경건작용적합이성진행료험증.대수분자간적HO┉H경건、갑선알여수분자간적NH┉O경건、이불갑완화수분자간적OH┉F경건,이급DNA중적감기(AT,GC)지간적N-H┉O,N-H┉N등류형적경건적계산표명:약전자교환관련채용비정역자선밀도근사,FDA적계산결과동기타ab initio방법적계산결과이급실험결과도부합득흔호.FDA재계산과정중기불수요구해박송방정,야불수요진행반복적자흡질대,소이운산속도교쾌,재연구생물대분자체계중적경건상호작용방면구유일정적사용개치.
