中国病毒学
中國病毒學
중국병독학
VIROLOGICA SINICA
2003年
3期
259-264
,共6页
刘光清%刘在新%张显升%常惠芸%郭慧琛%李冬%刘相涛%谢庆阁
劉光清%劉在新%張顯升%常惠蕓%郭慧琛%李鼕%劉相濤%謝慶閣
류광청%류재신%장현승%상혜예%곽혜침%리동%류상도%사경각
FMDV%OH99株%分子克隆%非编码区%结构蛋白
FMDV%OH99株%分子剋隆%非編碼區%結構蛋白
FMDV%OH99주%분자극륭%비편마구%결구단백
采用RT-PCR方法对FMDV OH99株基因组全序列进行了分子克隆与测序.结果表明OH99株基因组全基因组序列长8040nt,其中5'NCR长1026nt,前导蛋白(L)编码区长603nt.该毒株结构蛋白与非结构蛋白编码区的核苷酸序列为6318nt,3'NCR长93nt,其后是poly(A)尾巴,测序结果表明该结构至少含有56个A.应用分子生物学软件,将OH99株与其它参考毒株进行了序列比较,并对其基因特征、推导的氨基酸序列进行了研究分析.结果显示,在分类地位上OH99株归属于O型FMDV,与OTY TW/97具有较高的同源性,而与其他参考毒株的差异性比较大,而且在基因组功能未知区域和3A编码区域具有两处明显的基因片段缺失现象,其中3A编码区缺失30nt,与OTY TW/97株相同,但功能未知区域的缺失状况与OTY TW/97稍有差异.根据VP1基因序列,对OH99株与参考毒株进行了系统发生树分析,分析结果表明OH99株与OTY TW/97株在同一基因型内,其遗传关系最近,而与其毒株遗传关系较远.
採用RT-PCR方法對FMDV OH99株基因組全序列進行瞭分子剋隆與測序.結果錶明OH99株基因組全基因組序列長8040nt,其中5'NCR長1026nt,前導蛋白(L)編碼區長603nt.該毒株結構蛋白與非結構蛋白編碼區的覈苷痠序列為6318nt,3'NCR長93nt,其後是poly(A)尾巴,測序結果錶明該結構至少含有56箇A.應用分子生物學軟件,將OH99株與其它參攷毒株進行瞭序列比較,併對其基因特徵、推導的氨基痠序列進行瞭研究分析.結果顯示,在分類地位上OH99株歸屬于O型FMDV,與OTY TW/97具有較高的同源性,而與其他參攷毒株的差異性比較大,而且在基因組功能未知區域和3A編碼區域具有兩處明顯的基因片段缺失現象,其中3A編碼區缺失30nt,與OTY TW/97株相同,但功能未知區域的缺失狀況與OTY TW/97稍有差異.根據VP1基因序列,對OH99株與參攷毒株進行瞭繫統髮生樹分析,分析結果錶明OH99株與OTY TW/97株在同一基因型內,其遺傳關繫最近,而與其毒株遺傳關繫較遠.
채용RT-PCR방법대FMDV OH99주기인조전서렬진행료분자극륭여측서.결과표명OH99주기인조전기인조서렬장8040nt,기중5'NCR장1026nt,전도단백(L)편마구장603nt.해독주결구단백여비결구단백편마구적핵감산서렬위6318nt,3'NCR장93nt,기후시poly(A)미파,측서결과표명해결구지소함유56개A.응용분자생물학연건,장OH99주여기타삼고독주진행료서렬비교,병대기기인특정、추도적안기산서렬진행료연구분석.결과현시,재분류지위상OH99주귀속우O형FMDV,여OTY TW/97구유교고적동원성,이여기타삼고독주적차이성비교대,이차재기인조공능미지구역화3A편마구역구유량처명현적기인편단결실현상,기중3A편마구결실30nt,여OTY TW/97주상동,단공능미지구역적결실상황여OTY TW/97초유차이.근거VP1기인서렬,대OH99주여삼고독주진행료계통발생수분석,분석결과표명OH99주여OTY TW/97주재동일기인형내,기유전관계최근,이여기독주유전관계교원.
