蚕业科学
蠶業科學
잠업과학
ACTA SERICOLOGICA SINICA
2009年
1期
84-89
,共6页
李明乾%苘娜娜%蔡顺风%陈孝学%金伟%鲁兴萌
李明乾%苘娜娜%蔡順風%陳孝學%金偉%魯興萌
리명건%경나나%채순풍%진효학%금위%로흥맹
家蚕%传软性软化病毒%5'端非编码区%序列分析
傢蠶%傳軟性軟化病毒%5'耑非編碼區%序列分析
가잠%전연성연화병독%5'단비편마구%서렬분석
为了探讨家蚕传染性软化病病毒的复制与翻译机制,利用cDNA 5′末端快速扩增(5′-RACE)技术获得了家蚕传染性软化病病毒桐乡分离株(Bombyx mori infectious flacherie virus,BmIFV-2)的5′端非编码区(non-coding region,NCR).序列比较分析发现:BmIFV-2 的5′-NCR由155个核苷酸组成,A+U含量达60.64%,其中包含1个起始密码子AUG;与坂城分离株(BmIFV-1)的5′-NCR相比,BmIFV-2 的5′-NCR在5′末端缺少1个核苷酸,但核苷酸识别率为100%(即单核苷酸变异率为0),而且这个缺少的核苷酸并不影响其5′-NCR的二级结构.与已经证实具有内部核糖体进入位点(internal ribosome entry site,IRES)活性的Iflavirus属的2种病毒EoPV(Ectropis obliqua picorna-like virus)和VDV-1(Varroa destructor virus 1)的5′-NCR相比,BmIFV 的5′-NCR可能也具有IRES活性.
為瞭探討傢蠶傳染性軟化病病毒的複製與翻譯機製,利用cDNA 5′末耑快速擴增(5′-RACE)技術穫得瞭傢蠶傳染性軟化病病毒桐鄉分離株(Bombyx mori infectious flacherie virus,BmIFV-2)的5′耑非編碼區(non-coding region,NCR).序列比較分析髮現:BmIFV-2 的5′-NCR由155箇覈苷痠組成,A+U含量達60.64%,其中包含1箇起始密碼子AUG;與坂城分離株(BmIFV-1)的5′-NCR相比,BmIFV-2 的5′-NCR在5′末耑缺少1箇覈苷痠,但覈苷痠識彆率為100%(即單覈苷痠變異率為0),而且這箇缺少的覈苷痠併不影響其5′-NCR的二級結構.與已經證實具有內部覈糖體進入位點(internal ribosome entry site,IRES)活性的Iflavirus屬的2種病毒EoPV(Ectropis obliqua picorna-like virus)和VDV-1(Varroa destructor virus 1)的5′-NCR相比,BmIFV 的5′-NCR可能也具有IRES活性.
위료탐토가잠전염성연화병병독적복제여번역궤제,이용cDNA 5′말단쾌속확증(5′-RACE)기술획득료가잠전염성연화병병독동향분리주(Bombyx mori infectious flacherie virus,BmIFV-2)적5′단비편마구(non-coding region,NCR).서렬비교분석발현:BmIFV-2 적5′-NCR유155개핵감산조성,A+U함량체60.64%,기중포함1개기시밀마자AUG;여판성분리주(BmIFV-1)적5′-NCR상비,BmIFV-2 적5′-NCR재5′말단결소1개핵감산,단핵감산식별솔위100%(즉단핵감산변이솔위0),이차저개결소적핵감산병불영향기5′-NCR적이급결구.여이경증실구유내부핵당체진입위점(internal ribosome entry site,IRES)활성적Iflavirus속적2충병독EoPV(Ectropis obliqua picorna-like virus)화VDV-1(Varroa destructor virus 1)적5′-NCR상비,BmIFV 적5′-NCR가능야구유IRES활성.
