寄生虫与医学昆虫学报
寄生蟲與醫學昆蟲學報
기생충여의학곤충학보
ACTA PARASITOLOGICA ET MEDICA ENTOMOLOGICA SINICA
2008年
1期
20-25
,共6页
王进产%张龙现%赵金凤%宁长申%菅复春
王進產%張龍現%趙金鳳%寧長申%菅複春
왕진산%장룡현%조금봉%저장신%관복춘
隐孢子虫%丙酮酸%NADP+氧化还原酶%基因分型%种系发育关系
隱孢子蟲%丙酮痠%NADP+氧化還原酶%基因分型%種繫髮育關繫
은포자충%병동산%NADP+양화환원매%기인분형%충계발육관계
本文以核基因组的功能蛋白丙酮酸:NADP+氧化还原酶(pyruvate:NADP+ oxidoreductase,PNO)编码基因作为研究对象,对本实验室分离保存的隐孢子虫虫株进行扩增测序,用ClustalX 1.81对扩增序列与GenBank相关参考序列进行比对,用Paup4.0程序中邻接法(Neighbor-joining method,NJ)、最大简约法(Parsimonv,MP)和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)进行聚类分析,以确定不同隐孢子虫分离株之间的遗传进化关系,并以18S rRNA和HSP70基因构僵的基因树作参照,进而评价PNO这一基因座是否适合作为隐孢子虫基因分型和进化关系分析的基因座.结果表明通过PNO构建的进化树将隐孢子虫分为2大类:Cryptosporidium bailey和C.meleagridis处于一个分枝,C.hominis、C.parvum牛基因型和C.parvum鼠基因型处于另一个分枝上.不同隐孢子虫之间的同源性介于95.0%~100%,能有效区分隐孢子虫不同基因型.因此,PNO基因序列也适合作为隐孢子虫分离株种系发育的遗传标记.
本文以覈基因組的功能蛋白丙酮痠:NADP+氧化還原酶(pyruvate:NADP+ oxidoreductase,PNO)編碼基因作為研究對象,對本實驗室分離保存的隱孢子蟲蟲株進行擴增測序,用ClustalX 1.81對擴增序列與GenBank相關參攷序列進行比對,用Paup4.0程序中鄰接法(Neighbor-joining method,NJ)、最大簡約法(Parsimonv,MP)和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)進行聚類分析,以確定不同隱孢子蟲分離株之間的遺傳進化關繫,併以18S rRNA和HSP70基因構僵的基因樹作參照,進而評價PNO這一基因座是否適閤作為隱孢子蟲基因分型和進化關繫分析的基因座.結果錶明通過PNO構建的進化樹將隱孢子蟲分為2大類:Cryptosporidium bailey和C.meleagridis處于一箇分枝,C.hominis、C.parvum牛基因型和C.parvum鼠基因型處于另一箇分枝上.不同隱孢子蟲之間的同源性介于95.0%~100%,能有效區分隱孢子蟲不同基因型.因此,PNO基因序列也適閤作為隱孢子蟲分離株種繫髮育的遺傳標記.
본문이핵기인조적공능단백병동산:NADP+양화환원매(pyruvate:NADP+ oxidoreductase,PNO)편마기인작위연구대상,대본실험실분리보존적은포자충충주진행확증측서,용ClustalX 1.81대확증서렬여GenBank상관삼고서렬진행비대,용Paup4.0정서중린접법(Neighbor-joining method,NJ)、최대간약법(Parsimonv,MP)화최대사연법(Maximum Likelihood,ML)진행취류분석,이학정불동은포자충분리주지간적유전진화관계,병이18S rRNA화HSP70기인구강적기인수작삼조,진이평개PNO저일기인좌시부괄합작위은포자충기인분형화진화관계분석적기인좌.결과표명통과PNO구건적진화수장은포자충분위2대류:Cryptosporidium bailey화C.meleagridis처우일개분지,C.hominis、C.parvum우기인형화C.parvum서기인형처우령일개분지상.불동은포자충지간적동원성개우95.0%~100%,능유효구분은포자충불동기인형.인차,PNO기인서렬야괄합작위은포자충분리주충계발육적유전표기.