江苏农业学报
江囌農業學報
강소농업학보
JIANGSU JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2010年
2期
280-285
,共6页
马景蕃%侯喜林%肖栋%孙菲菲%单晓政%刘同坤
馬景蕃%侯喜林%肖棟%孫菲菲%單曉政%劉同坤
마경번%후희림%초동%손비비%단효정%류동곤
不结球白菜%抗病毒蛋白BcTuRsO%生物信息学
不結毬白菜%抗病毒蛋白BcTuRsO%生物信息學
불결구백채%항병독단백BcTuRsO%생물신식학
采用生物信息学方法,利用多种在线软件对不结球白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)蛋白BcTuRsO的系统进化、理化性质、亲水性、跨膜区、亚细胞定位、所含模体及蛋白质结构进行预测和分析.系统进化树分析结果表明,该蛋白在不同物种之间具有保守性.理化性质分析结果显示该酶含194个氨基酸,分子量为21 731.3,理论等电点pl值为6.60.TMpred跨膜分析结果显示,它含有1个显著的跨膜螺旋区,这个区域与ProtScale预测的疏水区基本重叠.用Target P server和WOLFPSORT server程序预测该蛋白为细胞质蛋白.结构域分析结果显示该蛋白含多种磷酸化位点.二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主.
採用生物信息學方法,利用多種在線軟件對不結毬白菜抗蕪菁花葉病毒(TuMV)蛋白BcTuRsO的繫統進化、理化性質、親水性、跨膜區、亞細胞定位、所含模體及蛋白質結構進行預測和分析.繫統進化樹分析結果錶明,該蛋白在不同物種之間具有保守性.理化性質分析結果顯示該酶含194箇氨基痠,分子量為21 731.3,理論等電點pl值為6.60.TMpred跨膜分析結果顯示,它含有1箇顯著的跨膜螺鏇區,這箇區域與ProtScale預測的疏水區基本重疊.用Target P server和WOLFPSORT server程序預測該蛋白為細胞質蛋白.結構域分析結果顯示該蛋白含多種燐痠化位點.二級結構以α-螺鏇和隨機捲麯為主.
채용생물신식학방법,이용다충재선연건대불결구백채항무정화협병독(TuMV)단백BcTuRsO적계통진화、이화성질、친수성、과막구、아세포정위、소함모체급단백질결구진행예측화분석.계통진화수분석결과표명,해단백재불동물충지간구유보수성.이화성질분석결과현시해매함194개안기산,분자량위21 731.3,이론등전점pl치위6.60.TMpred과막분석결과현시,타함유1개현저적과막라선구,저개구역여ProtScale예측적소수구기본중첩.용Target P server화WOLFPSORT server정서예측해단백위세포질단백.결구역분석결과현시해단백함다충린산화위점.이급결구이α-라선화수궤권곡위주.
