中国水稻科学
中國水稻科學
중국수도과학
CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE
2005年
4期
297-302
,共6页
杨庆文%陈成斌%张万霞%时津霞%任军方
楊慶文%陳成斌%張萬霞%時津霞%任軍方
양경문%진성빈%장만하%시진하%임군방
普通野生稻%居群%微卫星%等位变异%遗传结构%矩阵相关检测
普通野生稻%居群%微衛星%等位變異%遺傳結構%矩陣相關檢測
보통야생도%거군%미위성%등위변이%유전결구%구진상관검측
运用矩阵相关检测及聚类分析比较相结合的方法,在对广西玉林普通野生稻居群进行遗传结构分析中,从260至60每降低20个等位变异进行梯度取样,研究了不同SSR等位变异相似系数矩阵与总等位变异相似系数矩阵之间的相关关系.结果表明:1)当等位变异数为200时,居群内个体间的遗传关系与总变异数为277时个体间遗传关系的相关系数高达99.5%,达到极显著标准;如果将等位变异数梯度降低到10,则所有4个群体分别在等位变异数为180、190、210和200时与总变异数为277时个体间遗传关系的相关系数达到99.5%.2)当等位变异数减少到60时,其相关系数也达到95.0%的显著相关.3)所有4个群体在其相似系数达到99.5%时的聚类图与总变异数为277时的聚类图基本一致,只有个别样品在聚类图中的位置略有变化,但其相似系数为95.0%时聚类图与总变异数为277时的聚类图差异非常明显.因此,在进行普通野生稻居群遗传结构分析时,选择均匀分布于基因组的SSR引物并得到200个左右的等位变异时就能精确地获得居群内个体间的遗传关系.由于水稻SSR引物在野生稻居群遗传结构分析中的平均等位基因数约为4,所以,50对引物即能反映居群内个体间的遗传关系.
運用矩陣相關檢測及聚類分析比較相結閤的方法,在對廣西玉林普通野生稻居群進行遺傳結構分析中,從260至60每降低20箇等位變異進行梯度取樣,研究瞭不同SSR等位變異相似繫數矩陣與總等位變異相似繫數矩陣之間的相關關繫.結果錶明:1)噹等位變異數為200時,居群內箇體間的遺傳關繫與總變異數為277時箇體間遺傳關繫的相關繫數高達99.5%,達到極顯著標準;如果將等位變異數梯度降低到10,則所有4箇群體分彆在等位變異數為180、190、210和200時與總變異數為277時箇體間遺傳關繫的相關繫數達到99.5%.2)噹等位變異數減少到60時,其相關繫數也達到95.0%的顯著相關.3)所有4箇群體在其相似繫數達到99.5%時的聚類圖與總變異數為277時的聚類圖基本一緻,隻有箇彆樣品在聚類圖中的位置略有變化,但其相似繫數為95.0%時聚類圖與總變異數為277時的聚類圖差異非常明顯.因此,在進行普通野生稻居群遺傳結構分析時,選擇均勻分佈于基因組的SSR引物併得到200箇左右的等位變異時就能精確地穫得居群內箇體間的遺傳關繫.由于水稻SSR引物在野生稻居群遺傳結構分析中的平均等位基因數約為4,所以,50對引物即能反映居群內箇體間的遺傳關繫.
운용구진상관검측급취류분석비교상결합적방법,재대엄서옥림보통야생도거군진행유전결구분석중,종260지60매강저20개등위변이진행제도취양,연구료불동SSR등위변이상사계수구진여총등위변이상사계수구진지간적상관관계.결과표명:1)당등위변이수위200시,거군내개체간적유전관계여총변이수위277시개체간유전관계적상관계수고체99.5%,체도겁현저표준;여과장등위변이수제도강저도10,칙소유4개군체분별재등위변이수위180、190、210화200시여총변이수위277시개체간유전관계적상관계수체도99.5%.2)당등위변이수감소도60시,기상관계수야체도95.0%적현저상관.3)소유4개군체재기상사계수체도99.5%시적취류도여총변이수위277시적취류도기본일치,지유개별양품재취류도중적위치략유변화,단기상사계수위95.0%시취류도여총변이수위277시적취류도차이비상명현.인차,재진행보통야생도거군유전결구분석시,선택균균분포우기인조적SSR인물병득도200개좌우적등위변이시취능정학지획득거군내개체간적유전관계.유우수도SSR인물재야생도거군유전결구분석중적평균등위기인수약위4,소이,50대인물즉능반영거군내개체간적유전관계.