蚕业科学
蠶業科學
잠업과학
ACTA SERICOLOGICA SINICA
2004年
1期
24-27
,共4页
沈以红%程道军%查幸福%夏庆友%向仲怀
瀋以紅%程道軍%查倖福%夏慶友%嚮仲懷
침이홍%정도군%사행복%하경우%향중부
家蚕 脂肪体 表达序列标签(EST) 基因表达谱
傢蠶 脂肪體 錶達序列標籤(EST) 基因錶達譜
가잠 지방체 표체서렬표첨(EST) 기인표체보
以大规模EST测序为基础,用生物信息学方法分析了家蚕5龄3 d 脂肪体组织基因表达的特征,共获取脂肪体组织EST 12 721个.经Phrap程序拼接得到2 316个非冗余序列,其中包括824个contigs,1 492个singletons.在鉴定出的已知基因中,基因表达频率有明显差异:物质代谢相关基因表达量最高,占总量的58.2%;其次为转录翻译调节相关基因和酶类基因,分别占15.5%和14.5%.在高量表达基因中,有贮藏蛋白、蛋白酶抑制剂、类IDGF蛋白、抗菌蛋白、谷胱甘肽-S转移酶等.结果表明,脂肪体组织基因表达的种类很多,特征明显,与脂肪体在蚕体内的贮藏功能、蛋白质合成功能、代谢调节功能以及变态发育有密切关系.
以大規模EST測序為基礎,用生物信息學方法分析瞭傢蠶5齡3 d 脂肪體組織基因錶達的特徵,共穫取脂肪體組織EST 12 721箇.經Phrap程序拼接得到2 316箇非冗餘序列,其中包括824箇contigs,1 492箇singletons.在鑒定齣的已知基因中,基因錶達頻率有明顯差異:物質代謝相關基因錶達量最高,佔總量的58.2%;其次為轉錄翻譯調節相關基因和酶類基因,分彆佔15.5%和14.5%.在高量錶達基因中,有貯藏蛋白、蛋白酶抑製劑、類IDGF蛋白、抗菌蛋白、穀胱甘肽-S轉移酶等.結果錶明,脂肪體組織基因錶達的種類很多,特徵明顯,與脂肪體在蠶體內的貯藏功能、蛋白質閤成功能、代謝調節功能以及變態髮育有密切關繫.
이대규모EST측서위기출,용생물신식학방법분석료가잠5령3 d 지방체조직기인표체적특정,공획취지방체조직EST 12 721개.경Phrap정서병접득도2 316개비용여서렬,기중포괄824개contigs,1 492개singletons.재감정출적이지기인중,기인표체빈솔유명현차이:물질대사상관기인표체량최고,점총량적58.2%;기차위전록번역조절상관기인화매류기인,분별점15.5%화14.5%.재고량표체기인중,유저장단백、단백매억제제、류IDGF단백、항균단백、곡광감태-S전이매등.결과표명,지방체조직기인표체적충류흔다,특정명현,여지방체재잠체내적저장공능、단백질합성공능、대사조절공능이급변태발육유밀절관계.