中国水稻科学
中國水稻科學
중국수도과학
CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE
2011年
1期
1-10
,共10页
高清松%张丹%徐亮%徐辰武
高清鬆%張丹%徐亮%徐辰武
고청송%장단%서량%서신무
水稻%ABC1基因%进化分析%非生物胁迫%表达分析%基因功能%基因结构
水稻%ABC1基因%進化分析%非生物脅迫%錶達分析%基因功能%基因結構
수도%ABC1기인%진화분석%비생물협박%표체분석%기인공능%기인결구
ABC1(Activity of bc1 complex)家族属于蛋白质激酶家族,其成员普遍存在于原核和真核生物中.已有研究表明,几个植物ABC1基因参与非生物胁迫应答.为了解ABC1基因在水稻中的结构和功能,采用生物信息学方法分别在水稻和拟南芥上鉴定出15个和17个ABC1基因,并进行了系统发育和表达分析.结果表明,该家族在单、双子叶植物分离之前就已经发生了分化,其基本特征已经形成;单、双子叶植物分离之后,该家族在水稻和拟南芥中均以物种特异的方式进行了扩增.内含子/外显子结构分析显示多数直系同源基因之间外显子大小接近,而内含子差别较大,水稻含有更多大的内含子;内含子获得是近期伴随水稻ABC1家族进化的重要事件.多序列比对显示,ABC1结构域具有1个保守的氨基酸片段和4个保守的氨基酸残基.在线亚细胞定位预测9个水稻ABC1蛋白定位在叶绿体上.实时定量RT-PCR分析表明,水稻ABC1基因主要在叶片中表达,并且受多种非生物胁迫因素包括H2O2、脱落酸、低温、干旱、黑暗和高盐的调控.说明水稻ABC1家族不仅在逆境胁迫应答中发挥重要作用,可能还与水稻特定的生理过程有关.
ABC1(Activity of bc1 complex)傢族屬于蛋白質激酶傢族,其成員普遍存在于原覈和真覈生物中.已有研究錶明,幾箇植物ABC1基因參與非生物脅迫應答.為瞭解ABC1基因在水稻中的結構和功能,採用生物信息學方法分彆在水稻和擬南芥上鑒定齣15箇和17箇ABC1基因,併進行瞭繫統髮育和錶達分析.結果錶明,該傢族在單、雙子葉植物分離之前就已經髮生瞭分化,其基本特徵已經形成;單、雙子葉植物分離之後,該傢族在水稻和擬南芥中均以物種特異的方式進行瞭擴增.內含子/外顯子結構分析顯示多數直繫同源基因之間外顯子大小接近,而內含子差彆較大,水稻含有更多大的內含子;內含子穫得是近期伴隨水稻ABC1傢族進化的重要事件.多序列比對顯示,ABC1結構域具有1箇保守的氨基痠片段和4箇保守的氨基痠殘基.在線亞細胞定位預測9箇水稻ABC1蛋白定位在葉綠體上.實時定量RT-PCR分析錶明,水稻ABC1基因主要在葉片中錶達,併且受多種非生物脅迫因素包括H2O2、脫落痠、低溫、榦旱、黑暗和高鹽的調控.說明水稻ABC1傢族不僅在逆境脅迫應答中髮揮重要作用,可能還與水稻特定的生理過程有關.
ABC1(Activity of bc1 complex)가족속우단백질격매가족,기성원보편존재우원핵화진핵생물중.이유연구표명,궤개식물ABC1기인삼여비생물협박응답.위료해ABC1기인재수도중적결구화공능,채용생물신식학방법분별재수도화의남개상감정출15개화17개ABC1기인,병진행료계통발육화표체분석.결과표명,해가족재단、쌍자협식물분리지전취이경발생료분화,기기본특정이경형성;단、쌍자협식물분리지후,해가족재수도화의남개중균이물충특이적방식진행료확증.내함자/외현자결구분석현시다수직계동원기인지간외현자대소접근,이내함자차별교대,수도함유경다대적내함자;내함자획득시근기반수수도ABC1가족진화적중요사건.다서렬비대현시,ABC1결구역구유1개보수적안기산편단화4개보수적안기산잔기.재선아세포정위예측9개수도ABC1단백정위재협록체상.실시정량RT-PCR분석표명,수도ABC1기인주요재협편중표체,병차수다충비생물협박인소포괄H2O2、탈락산、저온、간한、흑암화고염적조공.설명수도ABC1가족불부재역경협박응답중발휘중요작용,가능환여수도특정적생리과정유관.
