大连理工大学学报
大連理工大學學報
대련리공대학학보
JOURNAL OF DALIAN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY
2011年
2期
163-168
,共6页
分子对接%配体%预测模型%信息熵
分子對接%配體%預測模型%信息熵
분자대접%배체%예측모형%신식적
将网格技术应用于药物分子对接中,能有效解决药物分子对接中所涉及的搜索空间巨大、时间耗费长、对计算环境要求高等问题.通过应用改进的遗传算法多种群竞争机制的对接演化模型GAsDock,以信息熵控制设计空间的收缩,增强了进化的目的性,显著地提高了对接效率.然后,利用线性、指数平滑和离散马尔可夫3种预测模型,并结合加权系数法,提高了分子对接任务的效率及各节点计算能力的自适应性.同时,采用了网格数据传输优化技术,降低了药物分子的传输时间,且能更有效地利用网格资源.实例测试表明了药物分子对接与网格技术相结合的合理性及有效性.
將網格技術應用于藥物分子對接中,能有效解決藥物分子對接中所涉及的搜索空間巨大、時間耗費長、對計算環境要求高等問題.通過應用改進的遺傳算法多種群競爭機製的對接縯化模型GAsDock,以信息熵控製設計空間的收縮,增彊瞭進化的目的性,顯著地提高瞭對接效率.然後,利用線性、指數平滑和離散馬爾可伕3種預測模型,併結閤加權繫數法,提高瞭分子對接任務的效率及各節點計算能力的自適應性.同時,採用瞭網格數據傳輸優化技術,降低瞭藥物分子的傳輸時間,且能更有效地利用網格資源.實例測試錶明瞭藥物分子對接與網格技術相結閤的閤理性及有效性.
장망격기술응용우약물분자대접중,능유효해결약물분자대접중소섭급적수색공간거대、시간모비장、대계산배경요구고등문제.통과응용개진적유전산법다충군경쟁궤제적대접연화모형GAsDock,이신식적공제설계공간적수축,증강료진화적목적성,현저지제고료대접효솔.연후,이용선성、지수평활화리산마이가부3충예측모형,병결합가권계수법,제고료분자대접임무적효솔급각절점계산능력적자괄응성.동시,채용료망격수거전수우화기술,강저료약물분자적전수시간,차능경유효지이용망격자원.실례측시표명료약물분자대접여망격기술상결합적합이성급유효성.