成都电子机械高等专科学校学报
成都電子機械高等專科學校學報
성도전자궤계고등전과학교학보
CHENGDU ELECTROMECHANICAL COLLEGE
2012年
1期
5-9
,共5页
范文杰%雷凯%向明礼%杨明理
範文傑%雷凱%嚮明禮%楊明理
범문걸%뢰개%향명례%양명리
分子识别%分子力学%分子动力学%分子模拟%分子对接
分子識彆%分子力學%分子動力學%分子模擬%分子對接
분자식별%분자역학%분자동역학%분자모의%분자대접
对1,1'-二萘基骨架的3个探针分子,采用Hyperchem和Gaussian 03先后进行分子力学优化、分子动力学模拟、半经验和HF/STO-3G水平几何构型优化.用AutoDock Vina将优化后的探针分子、配体分子α-氨基酸/α-氨基酸衍生物进行对接实验,获得相应的复合物的最佳作用模式并计算它们之间的亲和能.结果表明,理论计算所获得的探针分子与配体分子α-氨基酸/α-氨基酸衍生物之间的结合模式,与根据实验数据所推断的作用模式几乎完全相同；所计算的复合物之间的亲和能,也与实验测定的结合常数间有相同的变化趋势.
對1,1'-二萘基骨架的3箇探針分子,採用Hyperchem和Gaussian 03先後進行分子力學優化、分子動力學模擬、半經驗和HF/STO-3G水平幾何構型優化.用AutoDock Vina將優化後的探針分子、配體分子α-氨基痠/α-氨基痠衍生物進行對接實驗,穫得相應的複閤物的最佳作用模式併計算它們之間的親和能.結果錶明,理論計算所穫得的探針分子與配體分子α-氨基痠/α-氨基痠衍生物之間的結閤模式,與根據實驗數據所推斷的作用模式幾乎完全相同；所計算的複閤物之間的親和能,也與實驗測定的結閤常數間有相同的變化趨勢.
대1,1'-이내기골가적3개탐침분자,채용Hyperchem화Gaussian 03선후진행분자역학우화、분자동역학모의、반경험화HF/STO-3G수평궤하구형우화.용AutoDock Vina장우화후적탐침분자、배체분자α-안기산/α-안기산연생물진행대접실험,획득상응적복합물적최가작용모식병계산타문지간적친화능.결과표명,이론계산소획득적탐침분자여배체분자α-안기산/α-안기산연생물지간적결합모식,여근거실험수거소추단적작용모식궤호완전상동；소계산적복합물지간적친화능,야여실험측정적결합상수간유상동적변화추세.
