生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2009年
2期
155-158
,共4页
禽流感%血凝素%裂解位点%mRNA二级结构%动态折叠
禽流感%血凝素%裂解位點%mRNA二級結構%動態摺疊
금류감%혈응소%렬해위점%mRNA이급결구%동태절첩
以H5N2亚型禽流感病毒毒株血凝素蛋白裂解位点碱性氨基酸为研究对象,对其密码子偏好性和对应mRNA序列的折叠二级结构特点进行研究和分析.旨在探讨裂解位点氨基酸对应mRNA核苷酸片段的二级结构与病毒致病力的关系,希望能对禽流感病毒的研究提供一些基础性信息.将mRNA样本按照序列等步长递增的方法,用RNAstructure 4.1程序预测这些样本的动态延伸折叠二级结构.序列和结构的分析结果:裂解位点的碱性氨基酸对富含腺嘌呤的密码子有强烈偏好;与碱性氨基酸对应的mRNA片段上的核苷酸主要位于折叠二级结构的单链环区,少数位于配对螺旋区.结果表明:裂解位点氨基酸对应的mRNA核苷酸形成发夹端环的大小与其碱性氨基酸的多少具有正相关性.
以H5N2亞型禽流感病毒毒株血凝素蛋白裂解位點堿性氨基痠為研究對象,對其密碼子偏好性和對應mRNA序列的摺疊二級結構特點進行研究和分析.旨在探討裂解位點氨基痠對應mRNA覈苷痠片段的二級結構與病毒緻病力的關繫,希望能對禽流感病毒的研究提供一些基礎性信息.將mRNA樣本按照序列等步長遞增的方法,用RNAstructure 4.1程序預測這些樣本的動態延伸摺疊二級結構.序列和結構的分析結果:裂解位點的堿性氨基痠對富含腺嘌呤的密碼子有彊烈偏好;與堿性氨基痠對應的mRNA片段上的覈苷痠主要位于摺疊二級結構的單鏈環區,少數位于配對螺鏇區.結果錶明:裂解位點氨基痠對應的mRNA覈苷痠形成髮夾耑環的大小與其堿性氨基痠的多少具有正相關性.
이H5N2아형금류감병독독주혈응소단백렬해위점감성안기산위연구대상,대기밀마자편호성화대응mRNA서렬적절첩이급결구특점진행연구화분석.지재탐토렬해위점안기산대응mRNA핵감산편단적이급결구여병독치병력적관계,희망능대금류감병독적연구제공일사기출성신식.장mRNA양본안조서렬등보장체증적방법,용RNAstructure 4.1정서예측저사양본적동태연신절첩이급결구.서렬화결구적분석결과:렬해위점적감성안기산대부함선표령적밀마자유강렬편호;여감성안기산대응적mRNA편단상적핵감산주요위우절첩이급결구적단련배구,소수위우배대라선구.결과표명:렬해위점안기산대응적mRNA핵감산형성발협단배적대소여기감성안기산적다소구유정상관성.
