南方水产
南方水產
남방수산
SOUTH CHINA FISHERIES SCIENCE
2011年
1期
1-7
,共7页
陈大玮%邓利%刘志刚%孟铂渊%马一见
陳大瑋%鄧利%劉誌剛%孟鉑淵%馬一見
진대위%산리%류지강%맹박연%마일견
斜带石斑鱼%抗菌肽%hepcidin%分子克隆%原核融合表达
斜帶石斑魚%抗菌肽%hepcidin%分子剋隆%原覈融閤錶達
사대석반어%항균태%hepcidin%분자극륭%원핵융합표체
文章根据已报道的硬骨鱼类hepcidin cDNA序列设计简并引物,通过RT-PCR从重要海水经济鱼类斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)肝脏中扩增出1条具有完整开放阅读框的246 bp cDNA序列,Blast分析表明该序列是鱼类hepcidin基因家族的一员,被命名为斜带石斑鱼hepcidin样抗菌肽前体,该cDNA所推导的氨基酸序列有如下特点:1)信号肽序列与多数鱼类hepcidin信号肽的同源性在67%~87%之间;2)C端20个氨基酸序列具有绝大多数动物hepcidin成熟肽的共同典型保守序列特征,即在对应位置具有8个Cys;3)序列中不具有已报道的hepcidin前体肽转化酶作用典型基序[RX(K/R) R];4)与GenBank中已注册的2条斜带石斑鱼hepcidin cDNA序列(GU391241和GU391242)所推导的氨基酸序列同源性分别为36%和33%,且NJ进化树显示不与这2条序列聚为一枝,表明该序列是斜带石斑鱼hepcidin基因家族中一种新亚型,其预测成熟肽融合表达载体成功在大肠杆菌(Escherichia coli)中表达,为后续研究奠定基础.
文章根據已報道的硬骨魚類hepcidin cDNA序列設計簡併引物,通過RT-PCR從重要海水經濟魚類斜帶石斑魚(Epinephelus coioides)肝髒中擴增齣1條具有完整開放閱讀框的246 bp cDNA序列,Blast分析錶明該序列是魚類hepcidin基因傢族的一員,被命名為斜帶石斑魚hepcidin樣抗菌肽前體,該cDNA所推導的氨基痠序列有如下特點:1)信號肽序列與多數魚類hepcidin信號肽的同源性在67%~87%之間;2)C耑20箇氨基痠序列具有絕大多數動物hepcidin成熟肽的共同典型保守序列特徵,即在對應位置具有8箇Cys;3)序列中不具有已報道的hepcidin前體肽轉化酶作用典型基序[RX(K/R) R];4)與GenBank中已註冊的2條斜帶石斑魚hepcidin cDNA序列(GU391241和GU391242)所推導的氨基痠序列同源性分彆為36%和33%,且NJ進化樹顯示不與這2條序列聚為一枝,錶明該序列是斜帶石斑魚hepcidin基因傢族中一種新亞型,其預測成熟肽融閤錶達載體成功在大腸桿菌(Escherichia coli)中錶達,為後續研究奠定基礎.
문장근거이보도적경골어류hepcidin cDNA서렬설계간병인물,통과RT-PCR종중요해수경제어류사대석반어(Epinephelus coioides)간장중확증출1조구유완정개방열독광적246 bp cDNA서렬,Blast분석표명해서렬시어류hepcidin기인가족적일원,피명명위사대석반어hepcidin양항균태전체,해cDNA소추도적안기산서렬유여하특점:1)신호태서렬여다수어류hepcidin신호태적동원성재67%~87%지간;2)C단20개안기산서렬구유절대다수동물hepcidin성숙태적공동전형보수서렬특정,즉재대응위치구유8개Cys;3)서렬중불구유이보도적hepcidin전체태전화매작용전형기서[RX(K/R) R];4)여GenBank중이주책적2조사대석반어hepcidin cDNA서렬(GU391241화GU391242)소추도적안기산서렬동원성분별위36%화33%,차NJ진화수현시불여저2조서렬취위일지,표명해서렬시사대석반어hepcidin기인가족중일충신아형,기예측성숙태융합표체재체성공재대장간균(Escherichia coli)중표체,위후속연구전정기출.
