菌物学报
菌物學報
균물학보
MYCOSYSTEMA
2005年
3期
414-421
,共8页
肖长坤%郑建秋%李健强%师迎春%Hasan BOLKAN
肖長坤%鄭建鞦%李健彊%師迎春%Hasan BOLKAN
초장곤%정건추%리건강%사영춘%Hasan BOLKAN
聚类分析%分类鉴定%A.brassicae%A.brassicicola%A.japonica
聚類分析%分類鑒定%A.brassicae%A.brassicicola%A.japonica
취류분석%분류감정%A.brassicae%A.brassicicola%A.japonica
本文以来自国内外的20株白菜黑斑病菌及近源种为研究材料,进行了5.8S rDNA及其侧翼ITS区的克隆、测序、序列变异及遗传进化关系分析.黑斑病菌及其近源种真菌核糖体5.8S rDNA及其侧翼ITS区序列比对结果显示,不同种菌株ITS1比ITS2在碱基构成上有更大变异,而且ITS1的序列长度变异比ITS2的大;而种内虽然各菌株的寄主和地理来源不同,但ITS1和ITS2在长度上均没有变异,碱基构成上存在微小的变异.对该区序列的聚类分析表明,白菜黑斑病菌3个种芸薹链格孢Alternaria brassicae、甘蓝链格孢A.brassicicola和萝卜链格孢A.japonica虽然地理来源和寄主不同,但种内的不同菌株均在一个独立的聚类组中,种之间以及其和链格孢属内其它种在聚类关系上能明显分开,可基于该区进行黑斑病菌的分类鉴定.
本文以來自國內外的20株白菜黑斑病菌及近源種為研究材料,進行瞭5.8S rDNA及其側翼ITS區的剋隆、測序、序列變異及遺傳進化關繫分析.黑斑病菌及其近源種真菌覈糖體5.8S rDNA及其側翼ITS區序列比對結果顯示,不同種菌株ITS1比ITS2在堿基構成上有更大變異,而且ITS1的序列長度變異比ITS2的大;而種內雖然各菌株的寄主和地理來源不同,但ITS1和ITS2在長度上均沒有變異,堿基構成上存在微小的變異.對該區序列的聚類分析錶明,白菜黑斑病菌3箇種蕓薹鏈格孢Alternaria brassicae、甘藍鏈格孢A.brassicicola和蘿蔔鏈格孢A.japonica雖然地理來源和寄主不同,但種內的不同菌株均在一箇獨立的聚類組中,種之間以及其和鏈格孢屬內其它種在聚類關繫上能明顯分開,可基于該區進行黑斑病菌的分類鑒定.
본문이래자국내외적20주백채흑반병균급근원충위연구재료,진행료5.8S rDNA급기측익ITS구적극륭、측서、서렬변이급유전진화관계분석.흑반병균급기근원충진균핵당체5.8S rDNA급기측익ITS구서렬비대결과현시,불동충균주ITS1비ITS2재감기구성상유경대변이,이차ITS1적서렬장도변이비ITS2적대;이충내수연각균주적기주화지리래원불동,단ITS1화ITS2재장도상균몰유변이,감기구성상존재미소적변이.대해구서렬적취류분석표명,백채흑반병균3개충예대련격포Alternaria brassicae、감람련격포A.brassicicola화라복련격포A.japonica수연지리래원화기주불동,단충내적불동균주균재일개독립적취류조중,충지간이급기화련격포속내기타충재취류관계상능명현분개,가기우해구진행흑반병균적분류감정.