病毒学报
病毒學報
병독학보
CHINESE JOURNAL OF VIROLOGY
2008年
3期
202-207
,共6页
陈露菲%刘彦成%陈淑红%惠珊%李冀宏%许军
陳露菲%劉彥成%陳淑紅%惠珊%李冀宏%許軍
진로비%류언성%진숙홍%혜산%리기굉%허군
森林脑炎病毒%E蛋白基因%序列分析
森林腦炎病毒%E蛋白基因%序列分析
삼림뇌염병독%E단백기인%서렬분석
为了解分离自黑龙江省大兴安岭林区全沟硬蜱中的DXAL-5、12、13、16、18,21共6株森林脑炎(TBE)病毒E蛋白基因特征并确定病毒基因型,应用RT-PCR技术对6株病毒E蛋白基因进行体外扩增、克隆、测序.结果发现,6株病毒E蛋白基因的核苷酸序列长均为1 488 bp,推导的氨基酸序列长均为496 aa.与TBE参考毒株E蛋白基因进行比较,这6株病毒与远东亚型同源性最高,其次是西伯利亚亚型,与欧洲亚型同源性最差;在决定亚型特征的氨基酸位点多数属于TBE病毒远东亚型.E蛋白基因推导的氨基酸种系发生树分析表明,6株病毒均在远东亚型分枝内.因此就E蛋白基因而言,DXAL-5、12、13、16、18、21株均属于TBE病毒的远东亚型.新分离毒株与Senzhang株同源性较高,种系发生关系也比较接近,推测疫苗株对新分离毒株仍具有很好的保护作用.但是在E蛋白的A、B和C抗原决定区内,6株病毒均有不同程度的氨基酸改变,这些突变有可能影响E蛋白的功能.
為瞭解分離自黑龍江省大興安嶺林區全溝硬蜱中的DXAL-5、12、13、16、18,21共6株森林腦炎(TBE)病毒E蛋白基因特徵併確定病毒基因型,應用RT-PCR技術對6株病毒E蛋白基因進行體外擴增、剋隆、測序.結果髮現,6株病毒E蛋白基因的覈苷痠序列長均為1 488 bp,推導的氨基痠序列長均為496 aa.與TBE參攷毒株E蛋白基因進行比較,這6株病毒與遠東亞型同源性最高,其次是西伯利亞亞型,與歐洲亞型同源性最差;在決定亞型特徵的氨基痠位點多數屬于TBE病毒遠東亞型.E蛋白基因推導的氨基痠種繫髮生樹分析錶明,6株病毒均在遠東亞型分枝內.因此就E蛋白基因而言,DXAL-5、12、13、16、18、21株均屬于TBE病毒的遠東亞型.新分離毒株與Senzhang株同源性較高,種繫髮生關繫也比較接近,推測疫苗株對新分離毒株仍具有很好的保護作用.但是在E蛋白的A、B和C抗原決定區內,6株病毒均有不同程度的氨基痠改變,這些突變有可能影響E蛋白的功能.
위료해분리자흑룡강성대흥안령림구전구경비중적DXAL-5、12、13、16、18,21공6주삼림뇌염(TBE)병독E단백기인특정병학정병독기인형,응용RT-PCR기술대6주병독E단백기인진행체외확증、극륭、측서.결과발현,6주병독E단백기인적핵감산서렬장균위1 488 bp,추도적안기산서렬장균위496 aa.여TBE삼고독주E단백기인진행비교,저6주병독여원동아형동원성최고,기차시서백리아아형,여구주아형동원성최차;재결정아형특정적안기산위점다수속우TBE병독원동아형.E단백기인추도적안기산충계발생수분석표명,6주병독균재원동아형분지내.인차취E단백기인이언,DXAL-5、12、13、16、18、21주균속우TBE병독적원동아형.신분리독주여Senzhang주동원성교고,충계발생관계야비교접근,추측역묘주대신분리독주잉구유흔호적보호작용.단시재E단백적A、B화C항원결정구내,6주병독균유불동정도적안기산개변,저사돌변유가능영향E단백적공능.