计算机工程
計算機工程
계산궤공정
COMPUTER ENGINEERING
2009年
3期
91-93
,共3页
并行优化%EST序列库%分割部署
併行優化%EST序列庫%分割部署
병행우화%EST서렬고%분할부서
基于基因电脑克隆软件SiClone和可变剪接分析软件AltSplice的并行优化工作,提出一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案.该方案对所要进行比对分析的大规模序列库按某种策略进行分割部署,使机群中每个节点处理整个序列库的一部分,可有效减少磁盘I/O和节点间通信开销,适合低价高效的Linux机群系统.
基于基因電腦剋隆軟件SiClone和可變剪接分析軟件AltSplice的併行優化工作,提齣一種基于大規模序列比對軟件的併行優化方案.該方案對所要進行比對分析的大規模序列庫按某種策略進行分割部署,使機群中每箇節點處理整箇序列庫的一部分,可有效減少磁盤I/O和節點間通信開銷,適閤低價高效的Linux機群繫統.
기우기인전뇌극륭연건SiClone화가변전접분석연건AltSplice적병행우화공작,제출일충기우대규모서렬비대연건적병행우화방안.해방안대소요진행비대분석적대규모서렬고안모충책략진행분할부서,사궤군중매개절점처리정개서렬고적일부분,가유효감소자반I/O화절점간통신개소,괄합저개고효적Linux궤군계통.
