生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2010年
4期
128-131
,共4页
傅立元%高祥刚%李云峰%王健%赫崇波
傅立元%高祥剛%李雲峰%王健%赫崇波
부립원%고상강%리운봉%왕건%혁숭파
虾夷扇贝%Cdna文库%β-肌动蛋白%基因克隆%序列分析
蝦夷扇貝%Cdna文庫%β-肌動蛋白%基因剋隆%序列分析
하이선패%Cdna문고%β-기동단백%기인극륭%서렬분석
Mizuhopecten yessoensis%cDNA library%β-actin gene%Gene clone%Sequence analysis
为进一步研究虾夷扇贝功能基因的表达调控.利用SMART cDNA文库构建试剂盒成功构建了健康虾夷扇贝外套膜和肾脏两种组织的cDNA文库.对随机选取的4 009个克隆进行5'端测序,比对,筛选出1条β肌动蛋白同源序列,对此EST序列两端进行扩增、测序,得到肌动蛋白基因cDNA全长序列.肌动蛋白基因cDNA全长1 536 bp(不包括poly A) , 5'端非编码区84 bp, 3'端非翻译区321 bp,阅读框1 131 bp,编码377个氨基酸.在基因组DNA中,该基因被一个内含子分为两段,内含子位于第41和第42个氨基酸之间,长度为1 498 bp.系统发育分析显示该肌动蛋白属于β类型.本研究得到的虾夷扇贝β-肌动蛋白基因可以被用于作为定量某种虾夷扇贝mRNA的标准,这为继续研究虾夷扇贝其它功能基因,及其分子生物的进一步研究、促进其他相关分子发育和系统进化研究奠定了基础.
為進一步研究蝦夷扇貝功能基因的錶達調控.利用SMART cDNA文庫構建試劑盒成功構建瞭健康蝦夷扇貝外套膜和腎髒兩種組織的cDNA文庫.對隨機選取的4 009箇剋隆進行5'耑測序,比對,篩選齣1條β肌動蛋白同源序列,對此EST序列兩耑進行擴增、測序,得到肌動蛋白基因cDNA全長序列.肌動蛋白基因cDNA全長1 536 bp(不包括poly A) , 5'耑非編碼區84 bp, 3'耑非翻譯區321 bp,閱讀框1 131 bp,編碼377箇氨基痠.在基因組DNA中,該基因被一箇內含子分為兩段,內含子位于第41和第42箇氨基痠之間,長度為1 498 bp.繫統髮育分析顯示該肌動蛋白屬于β類型.本研究得到的蝦夷扇貝β-肌動蛋白基因可以被用于作為定量某種蝦夷扇貝mRNA的標準,這為繼續研究蝦夷扇貝其它功能基因,及其分子生物的進一步研究、促進其他相關分子髮育和繫統進化研究奠定瞭基礎.
위진일보연구하이선패공능기인적표체조공.이용SMART cDNA문고구건시제합성공구건료건강하이선패외투막화신장량충조직적cDNA문고.대수궤선취적4 009개극륭진행5'단측서,비대,사선출1조β기동단백동원서렬,대차EST서렬량단진행확증、측서,득도기동단백기인cDNA전장서렬.기동단백기인cDNA전장1 536 bp(불포괄poly A) , 5'단비편마구84 bp, 3'단비번역구321 bp,열독광1 131 bp,편마377개안기산.재기인조DNA중,해기인피일개내함자분위량단,내함자위우제41화제42개안기산지간,장도위1 498 bp.계통발육분석현시해기동단백속우β류형.본연구득도적하이선패β-기동단백기인가이피용우작위정량모충하이선패mRNA적표준,저위계속연구하이선패기타공능기인,급기분자생물적진일보연구、촉진기타상관분자발육화계통진화연구전정료기출.
The cDNA library from mantle and kidney of Mizuhopecten yessoensis was constructed using Creator SMART cDNA construction kit and large numbers of colonies were randomly picked and sequenced from the 5'. One EST with high homology with β-actin gene of other species was found and then the complete express sequence of β-actin from mizuhopecten yessoensis was obtained by PCR. The cDNA of this gene was 1 536 bp with 1 131 bp of ORF, which encodes 177 amino acids. The intron of this gene was 1 498 bp which cited between the 41st amino and the 42nd amino. The gene in this study is used for other genes' quantitative expression of Mizuhopecten yessoensis as an intemal control.