动物营养学报
動物營養學報
동물영양학보
ACTA ZOONUTRIMENTA SINICA
2010年
4期
992-999
,共8页
黄鳝%肠道%cDNA文库%表达序列标签%营养
黃鱔%腸道%cDNA文庫%錶達序列標籤%營養
황선%장도%cDNA문고%표체서렬표첨%영양
本研究旨在构建黄鳝肠道未剪切cDNA文库,对黄鳝肠道营养相关基因表达进行初步分析.以黄鳝全肠为试验材料,采用Invitrogen公司的Gateway技术构建了黄鳝肠道未剪切cDNA文库,并进行规模表达序列标签(expressed sequence tag,EST)测序和分析.结果表明:文库的库容量为1.46×107CFU,重组率达96.88%,平均插入片段长度2.11kb.随机挑取1056个cDNA阳性克隆进行测序,共获得906条有效的EST,其中886条的长度大于400bp,拼接组装得到762个单基因簇(unigene),包括61个重叠群(contig),701个单拷贝EST(singleton);与营养相关的EST共有5类59种,其中:蛋白质/氨基酸代谢类25种,碳水化合物代谢类13种,脂类代谢类5种,能量代谢类12种,无机离子代谢类4种.本文成功构建了黄鳝肠道未剪切cDNA文库,并进行了EST序列测定和分析,筛选出营养相关EST,为后续研究提供了基础数据.
本研究旨在構建黃鱔腸道未剪切cDNA文庫,對黃鱔腸道營養相關基因錶達進行初步分析.以黃鱔全腸為試驗材料,採用Invitrogen公司的Gateway技術構建瞭黃鱔腸道未剪切cDNA文庫,併進行規模錶達序列標籤(expressed sequence tag,EST)測序和分析.結果錶明:文庫的庫容量為1.46×107CFU,重組率達96.88%,平均插入片段長度2.11kb.隨機挑取1056箇cDNA暘性剋隆進行測序,共穫得906條有效的EST,其中886條的長度大于400bp,拼接組裝得到762箇單基因簇(unigene),包括61箇重疊群(contig),701箇單拷貝EST(singleton);與營養相關的EST共有5類59種,其中:蛋白質/氨基痠代謝類25種,碳水化閤物代謝類13種,脂類代謝類5種,能量代謝類12種,無機離子代謝類4種.本文成功構建瞭黃鱔腸道未剪切cDNA文庫,併進行瞭EST序列測定和分析,篩選齣營養相關EST,為後續研究提供瞭基礎數據.
본연구지재구건황선장도미전절cDNA문고,대황선장도영양상관기인표체진행초보분석.이황선전장위시험재료,채용Invitrogen공사적Gateway기술구건료황선장도미전절cDNA문고,병진행규모표체서렬표첨(expressed sequence tag,EST)측서화분석.결과표명:문고적고용량위1.46×107CFU,중조솔체96.88%,평균삽입편단장도2.11kb.수궤도취1056개cDNA양성극륭진행측서,공획득906조유효적EST,기중886조적장도대우400bp,병접조장득도762개단기인족(unigene),포괄61개중첩군(contig),701개단고패EST(singleton);여영양상관적EST공유5류59충,기중:단백질/안기산대사류25충,탄수화합물대사류13충,지류대사류5충,능량대사류12충,무궤리자대사류4충.본문성공구건료황선장도미전절cDNA문고,병진행료EST서렬측정화분석,사선출영양상관EST,위후속연구제공료기출수거.
