西北工业大学学报
西北工業大學學報
서북공업대학학보
JOURNAL OF NORTHWESTERN POLYTECHNICAL UNIVERSITY
2011年
1期
1-5
,共5页
王进科%冯萍%康继昌%陈亚东
王進科%馮萍%康繼昌%陳亞東
왕진과%풍평%강계창%진아동
双序列比对%协处理器%布尔逻辑%算法
雙序列比對%協處理器%佈爾邏輯%算法
쌍서렬비대%협처리기%포이라집%산법
文章针对基因研究中的快速完成双序列比对工作的需要,设计了一种双序列比对协处理器.该协处理器通过UsB接口与主机进行通信,采用基于布尔逻辑的比对算法完成双序列的比对.对碱基进行优化编码,使得用简单的门电路实现比对规则;使用流水寄存器,使得读碱基和序列比对并行工作,从而快速地完成具有显著相似性的DNA序列的比对.实验表明该协处理器具有结构简单、高效稳定、升级方便等特点.
文章針對基因研究中的快速完成雙序列比對工作的需要,設計瞭一種雙序列比對協處理器.該協處理器通過UsB接口與主機進行通信,採用基于佈爾邏輯的比對算法完成雙序列的比對.對堿基進行優化編碼,使得用簡單的門電路實現比對規則;使用流水寄存器,使得讀堿基和序列比對併行工作,從而快速地完成具有顯著相似性的DNA序列的比對.實驗錶明該協處理器具有結構簡單、高效穩定、升級方便等特點.
문장침대기인연구중적쾌속완성쌍서렬비대공작적수요,설계료일충쌍서렬비대협처리기.해협처리기통과UsB접구여주궤진행통신,채용기우포이라집적비대산법완성쌍서렬적비대.대감기진행우화편마,사득용간단적문전로실현비대규칙;사용류수기존기,사득독감기화서렬비대병행공작,종이쾌속지완성구유현저상사성적DNA서렬적비대.실험표명해협처리기구유결구간단、고효은정、승급방편등특점.
