遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2008年
9期
1228-1236
,共9页
刘刚%彭惠茹%倪中福%秦丹丹%宋方威%宋广树%孙其信
劉剛%彭惠茹%倪中福%秦丹丹%宋方威%宋廣樹%孫其信
류강%팽혜여%예중복%진단단%송방위%송엄수%손기신
eQTL%个体选择%基因芯片实验设计%作图方法
eQTL%箇體選擇%基因芯片實驗設計%作圖方法
eQTL%개체선택%기인심편실험설계%작도방법
高通量的基因型分析和芯片技术的发展使人们能够进一步研究哪些遗传差异最终影响基因的表达.通过表达数量性状座位(eQTL)作图方法可对基因表达水平的遗传基础进行解析.与传统的QTL分析方法一样,eQTL的主要目标是鉴别表达性状座位所在的染色体区域.但由于表达谱数据成千上万,而传统的QTL分析方法最多分析几十个性状,因此需要考虑这类实验设计的特点以及统计分析方法.本文详细介绍了eQTL定位过程及其研究方法,重点从个体选择、基因芯片实验设计、基因表达数据的获得与标准化、作图方法及结果分析等方面进行了综述,指出了当前eQTL研究存在的问题和局限性.最后介绍了eQTL研究在估计基因表达遗传率、挖掘候选基因、构建基因调控网络、理解基因间及基因与环境的互作的应用进展.
高通量的基因型分析和芯片技術的髮展使人們能夠進一步研究哪些遺傳差異最終影響基因的錶達.通過錶達數量性狀座位(eQTL)作圖方法可對基因錶達水平的遺傳基礎進行解析.與傳統的QTL分析方法一樣,eQTL的主要目標是鑒彆錶達性狀座位所在的染色體區域.但由于錶達譜數據成韆上萬,而傳統的QTL分析方法最多分析幾十箇性狀,因此需要攷慮這類實驗設計的特點以及統計分析方法.本文詳細介紹瞭eQTL定位過程及其研究方法,重點從箇體選擇、基因芯片實驗設計、基因錶達數據的穫得與標準化、作圖方法及結果分析等方麵進行瞭綜述,指齣瞭噹前eQTL研究存在的問題和跼限性.最後介紹瞭eQTL研究在估計基因錶達遺傳率、挖掘候選基因、構建基因調控網絡、理解基因間及基因與環境的互作的應用進展.
고통량적기인형분석화심편기술적발전사인문능구진일보연구나사유전차이최종영향기인적표체.통과표체수량성상좌위(eQTL)작도방법가대기인표체수평적유전기출진행해석.여전통적QTL분석방법일양,eQTL적주요목표시감별표체성상좌위소재적염색체구역.단유우표체보수거성천상만,이전통적QTL분석방법최다분석궤십개성상,인차수요고필저류실험설계적특점이급통계분석방법.본문상세개소료eQTL정위과정급기연구방법,중점종개체선택、기인심편실험설계、기인표체수거적획득여표준화、작도방법급결과분석등방면진행료종술,지출료당전eQTL연구존재적문제화국한성.최후개소료eQTL연구재고계기인표체유전솔、알굴후선기인、구건기인조공망락、리해기인간급기인여배경적호작적응용진전.
