基于SSU rDNA和线粒体cox1序列分析甲藻中不同生态类群的演化规律
기우SSU rDNA화선립체cox1서렬분석갑조중불동생태류군적연화규률
Analysis of the evolution of different ecological groups of dinoflagellates based on SSU rDNA and mitochondrial cox 1 sequences
  • 万方数据
    中国水产科学 중국수산과학
    Journal of Fishery Sciences of China
    2012年 4期 577-585 ,共9页

    唐晨%董丽%饶涛%贾睿%于克锋%吴维宁%王金辉%徐韧%何培民

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    浮游型甲藻%底柄型甲藻%利玛原甲藻%强壮前沟藻%SSU rDNA%cox1 浮遊型甲藻%底柄型甲藻%利瑪原甲藻%彊壯前溝藻%SSU rDNA%cox1
    부유형갑조%저병형갑조%리마원갑조%강장전구조%SSU rDNA%cox1
    应用SSU rDNA和线粒体cox1序列研究甲藻(Dinoflagellate)中不同生态类群的演化关系.通过PCR扩增和测序获取4株甲藻SSU rDNA及其线粒体cox1部分片段,结合GenBank中24株甲藻的相关序列,以Plasmodiumfalciparum为外群,构建ML树和NJ树,并采用自展支持度评估进化树分支结构,通过计算后验概率评估进化树整体结构,应用1sKH、SH、ELW和2sKH等方法评估两株ML树间的拓扑结构.结果显示,在由上述两序列构建的进化树上,底栖原甲藻均未与浮游原甲藻聚类,且前沟藻具有独特演化地位.表明联合选择SSU rDNA和线粒体c甜1序列构建的进化树在一定程度上能够反映出甲藻的演化规律.这为从基因层面深入探索甲藻中不同生态类群的演化关系初步奠定了基础.
    응용SSU rDNA화선립체cox1서렬연구갑조(Dinoflagellate)중불동생태류군적연화관계.통과PCR확증화측서획취4주갑조SSU rDNA급기선립체cox1부분편단,결합GenBank중24주갑조적상관서렬,이Plasmodiumfalciparum위외군,구건ML수화NJ수,병채용자전지지도평고진화수분지결구,통과계산후험개솔평고진화수정체결구,응용1sKH、SH、ELW화2sKH등방법평고량주ML수간적탁복결구.결과현시,재유상술량서렬구건적진화수상,저서원갑조균미여부유원갑조취류,차전구조구유독특연화지위.표명연합선택SSU rDNA화선립체c첨1서렬구건적진화수재일정정도상능구반영출갑조적연화규률.저위종기인층면심입탐색갑조중불동생태류군적연화관계초보전정료기출.
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