遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2010年
7期
701-711
,共11页
H1N1流感病毒%受体结合位点%变异特征%生物信息学分析
H1N1流感病毒%受體結閤位點%變異特徵%生物信息學分析
H1N1류감병독%수체결합위점%변이특정%생물신식학분석
2009年全球性爆发的H1N1病毒已经导致213个国家和地区受到感染,有16226人死亡.病毒与宿主细胞表面受体的结合是病毒感染不可缺少的第一步,从而导致病毒膜与宿主细胞膜的融合.血凝素(Hemagglutinin,HA)就是介导这种受体结合与膜融合的病毒蛋白,受体结合位点(Receptor binding sites,RBSs)位于HA蛋白三聚体中每个单体的球形头部,主要由190位螺旋(190～198aa)、130位环(135～138aa)和220位环(221～228)3个二级结构域组成.文章收集了1918～2009年间1221株H1N1病毒株的HA1序列(长度为327个氨基酸残基),通过序列比对、各位点氨基酸残基的熵值以及3D结构模拟等生物信息学研究.结果显示不同宿主的不同病毒RBSs具有不同的熵值,而且不同宿主的病毒HA1其RBSs具有不同的优势序列.3D结构模拟也显示了H1N1不同HA1之间在190位螺旋构象上的细微差异.该研究揭示了不同HA1上RBSs的一些新的特征,为进一步探讨病毒感染的机理提供了新的信息.
2009年全毬性爆髮的H1N1病毒已經導緻213箇國傢和地區受到感染,有16226人死亡.病毒與宿主細胞錶麵受體的結閤是病毒感染不可缺少的第一步,從而導緻病毒膜與宿主細胞膜的融閤.血凝素(Hemagglutinin,HA)就是介導這種受體結閤與膜融閤的病毒蛋白,受體結閤位點(Receptor binding sites,RBSs)位于HA蛋白三聚體中每箇單體的毬形頭部,主要由190位螺鏇(190～198aa)、130位環(135～138aa)和220位環(221～228)3箇二級結構域組成.文章收集瞭1918～2009年間1221株H1N1病毒株的HA1序列(長度為327箇氨基痠殘基),通過序列比對、各位點氨基痠殘基的熵值以及3D結構模擬等生物信息學研究.結果顯示不同宿主的不同病毒RBSs具有不同的熵值,而且不同宿主的病毒HA1其RBSs具有不同的優勢序列.3D結構模擬也顯示瞭H1N1不同HA1之間在190位螺鏇構象上的細微差異.該研究揭示瞭不同HA1上RBSs的一些新的特徵,為進一步探討病毒感染的機理提供瞭新的信息.
2009년전구성폭발적H1N1병독이경도치213개국가화지구수도감염,유16226인사망.병독여숙주세포표면수체적결합시병독감염불가결소적제일보,종이도치병독막여숙주세포막적융합.혈응소(Hemagglutinin,HA)취시개도저충수체결합여막융합적병독단백,수체결합위점(Receptor binding sites,RBSs)위우HA단백삼취체중매개단체적구형두부,주요유190위라선(190～198aa)、130위배(135～138aa)화220위배(221～228)3개이급결구역조성.문장수집료1918～2009년간1221주H1N1병독주적HA1서렬(장도위327개안기산잔기),통과서렬비대、각위점안기산잔기적적치이급3D결구모의등생물신식학연구.결과현시불동숙주적불동병독RBSs구유불동적적치,이차불동숙주적병독HA1기RBSs구유불동적우세서렬.3D결구모의야현시료H1N1불동HA1지간재190위라선구상상적세미차이.해연구게시료불동HA1상RBSs적일사신적특정,위진일보탐토병독감염적궤리제공료신적신식.
