南京师大学报(自然科学版)
南京師大學報(自然科學版)
남경사대학보(자연과학판)
JOURNAL OF NANJING NORMAL UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE EDITION)
2011年
1期
96-101
,共6页
毕可然%顾伟%王文%阎斌伦%张晓君
畢可然%顧偉%王文%閻斌倫%張曉君
필가연%고위%왕문%염빈륜%장효군
螺原体%16S rRNA基因%16S-23S rRNA基因间隔区序列%系统发生关系
螺原體%16S rRNA基因%16S-23S rRNA基因間隔區序列%繫統髮生關繫
라원체%16S rRNA기인%16S-23S rRNA기인간격구서렬%계통발생관계
采集江苏省养殖池塘内发病的中华绒螯蟹、克氏原螯虾和南美白对虾,利用已有螺原体16S rRNA和23S rRNA基因序列保守引物扩增并测序16S rRNA和16S-23S rRNA基因间隔区序列(ISRs).基于已获得的序列和GenBank中下载的螺原体序列分别进行同源性比对,比对的结果分别利用PAUP软件和MrBayes软件提供的最大似然法和贝叶斯法进行系统发生关系分析.分析结果是:所有淡水甲壳动物螺原体菌株Spiroplasma eriocheiris(中华绒螯蟹)、Spiroplasma sp.CRAYFISH(克氏原螯虾)、Spiroplasma sp.SHRIMP(南美白对虾)严格聚为一支,并且与陆生兔扁虱螺原体(非凡螺原体)Spiroplasma mirum关系最近,而与中国报道的陆生植物螺原体菌株Spiroplasma sp.CR-1(油菜)、Spiroplasma sp.CNR-1(油菜)、Spiroplasma sp.CNR-2(油菜)、Spiroplasma sp.CAN-1(杜鹃花)、Spiroplasma sp.CRW-1(红花酢浆草)及昆虫螺原体菌株Spiroplasma sp.CH-1(蜜蜂)、Spiroplasma sp.M10(蜜蜂)关系较远,此外,3个淡水甲壳动物螺原体菌株与现今唯一报道的海水南美白对虾螺原体Spiroplasma penaei系统发生关系也很远.因此,在螺原体属中,我国发现的淡水甲壳动物螺原体近缘种是非凡螺原体而不是我国陆生昆虫或植物螺原体及美洲的南美白对虾螺原体.
採集江囌省養殖池塘內髮病的中華絨螯蟹、剋氏原螯蝦和南美白對蝦,利用已有螺原體16S rRNA和23S rRNA基因序列保守引物擴增併測序16S rRNA和16S-23S rRNA基因間隔區序列(ISRs).基于已穫得的序列和GenBank中下載的螺原體序列分彆進行同源性比對,比對的結果分彆利用PAUP軟件和MrBayes軟件提供的最大似然法和貝葉斯法進行繫統髮生關繫分析.分析結果是:所有淡水甲殼動物螺原體菌株Spiroplasma eriocheiris(中華絨螯蟹)、Spiroplasma sp.CRAYFISH(剋氏原螯蝦)、Spiroplasma sp.SHRIMP(南美白對蝦)嚴格聚為一支,併且與陸生兔扁虱螺原體(非凡螺原體)Spiroplasma mirum關繫最近,而與中國報道的陸生植物螺原體菌株Spiroplasma sp.CR-1(油菜)、Spiroplasma sp.CNR-1(油菜)、Spiroplasma sp.CNR-2(油菜)、Spiroplasma sp.CAN-1(杜鵑花)、Spiroplasma sp.CRW-1(紅花酢漿草)及昆蟲螺原體菌株Spiroplasma sp.CH-1(蜜蜂)、Spiroplasma sp.M10(蜜蜂)關繫較遠,此外,3箇淡水甲殼動物螺原體菌株與現今唯一報道的海水南美白對蝦螺原體Spiroplasma penaei繫統髮生關繫也很遠.因此,在螺原體屬中,我國髮現的淡水甲殼動物螺原體近緣種是非凡螺原體而不是我國陸生昆蟲或植物螺原體及美洲的南美白對蝦螺原體.
채집강소성양식지당내발병적중화융오해、극씨원오하화남미백대하,이용이유라원체16S rRNA화23S rRNA기인서렬보수인물확증병측서16S rRNA화16S-23S rRNA기인간격구서렬(ISRs).기우이획득적서렬화GenBank중하재적라원체서렬분별진행동원성비대,비대적결과분별이용PAUP연건화MrBayes연건제공적최대사연법화패협사법진행계통발생관계분석.분석결과시:소유담수갑각동물라원체균주Spiroplasma eriocheiris(중화융오해)、Spiroplasma sp.CRAYFISH(극씨원오하)、Spiroplasma sp.SHRIMP(남미백대하)엄격취위일지,병차여륙생토편슬라원체(비범라원체)Spiroplasma mirum관계최근,이여중국보도적륙생식물라원체균주Spiroplasma sp.CR-1(유채)、Spiroplasma sp.CNR-1(유채)、Spiroplasma sp.CNR-2(유채)、Spiroplasma sp.CAN-1(두견화)、Spiroplasma sp.CRW-1(홍화작장초)급곤충라원체균주Spiroplasma sp.CH-1(밀봉)、Spiroplasma sp.M10(밀봉)관계교원,차외,3개담수갑각동물라원체균주여현금유일보도적해수남미백대하라원체Spiroplasma penaei계통발생관계야흔원.인차,재라원체속중,아국발현적담수갑각동물라원체근연충시비범라원체이불시아국륙생곤충혹식물라원체급미주적남미백대하라원체.