计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2010年
4期
443-446
,共4页
ABEEM/MM-MD%芳香胺离子%溶剂影响%径向分布函数%电荷
ABEEM/MM-MD%芳香胺離子%溶劑影響%徑嚮分佈函數%電荷
ABEEM/MM-MD%방향알리자%용제영향%경향분포함수%전하
芳香胺离子是芳香胺致癌进程中产生的中间体,它与嘌呤核酸反应,生成芳香胺-DNA加成物,从而导致癌症的发生.在之前的理论研究中,我们发现,N7质子化的嘌呤与芳香胺离子反应时,过渡态的气相和液相中激发能差别很大,其具体原因还不清楚.因此,本文中,应用ABEEM/MM-MD分子动力学模拟方法,研究了溶剂对这类反应的影响.在具体的溶剂模拟中,我们使用显含的水分子作为溶剂,模拟得到了整个反应过程中N7质子化嘌呤与芳香胺离子的水的径向分布函数.分析这些结果可以发现,当反应进行到有过渡态出现时,水溶剂与过渡态的相互作用会变的比反应初始阶段强得多.从这个结果,可以得到过渡态的激发能在气相和液相中差别很大的原因是,在液相反应中,水溶剂与过渡态比较强的相互作用降低了过渡态的激发能.此外,我们也使用ABEEM方法得到了所研究反应过程中的电荷变化情况.
芳香胺離子是芳香胺緻癌進程中產生的中間體,它與嘌呤覈痠反應,生成芳香胺-DNA加成物,從而導緻癌癥的髮生.在之前的理論研究中,我們髮現,N7質子化的嘌呤與芳香胺離子反應時,過渡態的氣相和液相中激髮能差彆很大,其具體原因還不清楚.因此,本文中,應用ABEEM/MM-MD分子動力學模擬方法,研究瞭溶劑對這類反應的影響.在具體的溶劑模擬中,我們使用顯含的水分子作為溶劑,模擬得到瞭整箇反應過程中N7質子化嘌呤與芳香胺離子的水的徑嚮分佈函數.分析這些結果可以髮現,噹反應進行到有過渡態齣現時,水溶劑與過渡態的相互作用會變的比反應初始階段彊得多.從這箇結果,可以得到過渡態的激髮能在氣相和液相中差彆很大的原因是,在液相反應中,水溶劑與過渡態比較彊的相互作用降低瞭過渡態的激髮能.此外,我們也使用ABEEM方法得到瞭所研究反應過程中的電荷變化情況.
방향알리자시방향알치암진정중산생적중간체,타여표령핵산반응,생성방향알-DNA가성물,종이도치암증적발생.재지전적이론연구중,아문발현,N7질자화적표령여방향알리자반응시,과도태적기상화액상중격발능차별흔대,기구체원인환불청초.인차,본문중,응용ABEEM/MM-MD분자동역학모의방법,연구료용제대저류반응적영향.재구체적용제모의중,아문사용현함적수분자작위용제,모의득도료정개반응과정중N7질자화표령여방향알리자적수적경향분포함수.분석저사결과가이발현,당반응진행도유과도태출현시,수용제여과도태적상호작용회변적비반응초시계단강득다.종저개결과,가이득도과도태적격발능재기상화액상중차별흔대적원인시,재액상반응중,수용제여과도태비교강적상호작용강저료과도태적격발능.차외,아문야사용ABEEM방법득도료소연구반응과정중적전하변화정황.
