生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2012年
2期
151-158
,共8页
何宣%王白羽%张晓磊%任丽彤%孔广超
何宣%王白羽%張曉磊%任麗彤%孔廣超
하선%왕백우%장효뢰%임려동%공엄초
小黑麦%碳酸酐酶%分子结构%结构预测%结构比对
小黑麥%碳痠酐酶%分子結構%結構預測%結構比對
소흑맥%탄산항매%분자결구%결구예측%결구비대
根据已经克隆到的小黑麦碳酸酐酶基因序列,将其概念地翻译成蛋白质的氨基酸序列.利用MEGA4.1、DNAStarS.02、SOPMA、Swiss-Model Workspace和NCBI-VAST等在线软件和服务器对该小黑麦碳酸酐酶(CA)的一级结构、二级结构及三维结构进行了分子结构模型预测,并对其三维结构进行了比对.结果显示,小黑麦碳酸酐酶定位于线粒体内膜和叶绿体类囊体膜上,具有β类碳酸酐酶所特有的保守性基序C-[SA]-D-S-R-[LIVM]-x-[AP];SOPMA预测的二级结构显示,该酶含有α-螺旋(38.61％)、随机卷曲(54.44％)和β-折叠(6.95％).通过VAST矢量比对工具将小黑麦碳酸酐酶与模板(lekjA)三维结构进行比对,结果显示小黑麦碳酸酐酶与豌豆β碳酸酐酶同型八聚体中的一个单体( lekjA)具有很好的匹配,故推测小黑麦碳酸酐酶全酶也可能是同型八聚体.
根據已經剋隆到的小黑麥碳痠酐酶基因序列,將其概唸地翻譯成蛋白質的氨基痠序列.利用MEGA4.1、DNAStarS.02、SOPMA、Swiss-Model Workspace和NCBI-VAST等在線軟件和服務器對該小黑麥碳痠酐酶(CA)的一級結構、二級結構及三維結構進行瞭分子結構模型預測,併對其三維結構進行瞭比對.結果顯示,小黑麥碳痠酐酶定位于線粒體內膜和葉綠體類囊體膜上,具有β類碳痠酐酶所特有的保守性基序C-[SA]-D-S-R-[LIVM]-x-[AP];SOPMA預測的二級結構顯示,該酶含有α-螺鏇(38.61％)、隨機捲麯(54.44％)和β-摺疊(6.95％).通過VAST矢量比對工具將小黑麥碳痠酐酶與模闆(lekjA)三維結構進行比對,結果顯示小黑麥碳痠酐酶與豌豆β碳痠酐酶同型八聚體中的一箇單體( lekjA)具有很好的匹配,故推測小黑麥碳痠酐酶全酶也可能是同型八聚體.
근거이경극륭도적소흑맥탄산항매기인서렬,장기개념지번역성단백질적안기산서렬.이용MEGA4.1、DNAStarS.02、SOPMA、Swiss-Model Workspace화NCBI-VAST등재선연건화복무기대해소흑맥탄산항매(CA)적일급결구、이급결구급삼유결구진행료분자결구모형예측,병대기삼유결구진행료비대.결과현시,소흑맥탄산항매정위우선립체내막화협록체류낭체막상,구유β류탄산항매소특유적보수성기서C-[SA]-D-S-R-[LIVM]-x-[AP];SOPMA예측적이급결구현시,해매함유α-라선(38.61％)、수궤권곡(54.44％)화β-절첩(6.95％).통과VAST시량비대공구장소흑맥탄산항매여모판(lekjA)삼유결구진행비대,결과현시소흑맥탄산항매여완두β탄산항매동형팔취체중적일개단체( lekjA)구유흔호적필배,고추측소흑맥탄산항매전매야가능시동형팔취체.
