中华血液学杂志
中華血液學雜誌
중화혈액학잡지
Chinese Journal of Hematology
2012年
5期
371-377
,共7页
周全全%王晓娟%竺晓凡%袁卫平%程涛
週全全%王曉娟%竺曉凡%袁衛平%程濤
주전전%왕효연%축효범%원위평%정도
范可尼贫血%肿瘤易感性%基因表达谱%基因集富集分析
範可尼貧血%腫瘤易感性%基因錶達譜%基因集富集分析
범가니빈혈%종류역감성%기인표체보%기인집부집분석
目的 探讨范可尼贫血(FA)患者高肿瘤易感性的潜在机制与原因.方法 采用基因集富集分析(Gene set enrichment analysis,GSEA)对NCBI GEO数据库中21例FA患者和11例健康志愿者的骨髓单个核细胞基因表达谱进行比较研究,分析其在肿瘤相关通路及肿瘤相关基因集中的富集特征与核心富集基因.然后利用对基因本体学(Gene ontology)生物过程和结构基因组相关基因集的富集分析,迸一步阐释了该病高肿瘤易感性的潜在原因.结果 FA患者在抗Bcl-2抑制剂相关基因集和成纤维细胞生长因子、胰岛素及胰岛素样生长因子(IGF)信号通路介导的肿瘤基因集中有显著富集特征.其中核心富集基因D4S234E、SST、FGF、IGFR、FGFR和IGFBP等的高表达与促进肿瘤形成及耐药相关.在生物学过程上,FA患者细胞外分子的生物合成和结构与对照组具有显著差异.在结构基因组相关分析中发现,包含上述IGF2在内的转录起始位点附近具有模体RRCAGGTGNCV及CCTNTMAGA的基因集具有富集特征,其中前者与肿瘤发生的关键转录因子TCF3匹配.结论 FA患者的高肿瘤易感性与其体内在关键转录因子介导下的肿瘤相关细胞因子、激素等内环境变化密切相关.
目的 探討範可尼貧血(FA)患者高腫瘤易感性的潛在機製與原因.方法 採用基因集富集分析(Gene set enrichment analysis,GSEA)對NCBI GEO數據庫中21例FA患者和11例健康誌願者的骨髓單箇覈細胞基因錶達譜進行比較研究,分析其在腫瘤相關通路及腫瘤相關基因集中的富集特徵與覈心富集基因.然後利用對基因本體學(Gene ontology)生物過程和結構基因組相關基因集的富集分析,迸一步闡釋瞭該病高腫瘤易感性的潛在原因.結果 FA患者在抗Bcl-2抑製劑相關基因集和成纖維細胞生長因子、胰島素及胰島素樣生長因子(IGF)信號通路介導的腫瘤基因集中有顯著富集特徵.其中覈心富集基因D4S234E、SST、FGF、IGFR、FGFR和IGFBP等的高錶達與促進腫瘤形成及耐藥相關.在生物學過程上,FA患者細胞外分子的生物閤成和結構與對照組具有顯著差異.在結構基因組相關分析中髮現,包含上述IGF2在內的轉錄起始位點附近具有模體RRCAGGTGNCV及CCTNTMAGA的基因集具有富集特徵,其中前者與腫瘤髮生的關鍵轉錄因子TCF3匹配.結論 FA患者的高腫瘤易感性與其體內在關鍵轉錄因子介導下的腫瘤相關細胞因子、激素等內環境變化密切相關.
목적 탐토범가니빈혈(FA)환자고종류역감성적잠재궤제여원인.방법 채용기인집부집분석(Gene set enrichment analysis,GSEA)대NCBI GEO수거고중21례FA환자화11례건강지원자적골수단개핵세포기인표체보진행비교연구,분석기재종류상관통로급종류상관기인집중적부집특정여핵심부집기인.연후이용대기인본체학(Gene ontology)생물과정화결구기인조상관기인집적부집분석,병일보천석료해병고종류역감성적잠재원인.결과 FA환자재항Bcl-2억제제상관기인집화성섬유세포생장인자、이도소급이도소양생장인자(IGF)신호통로개도적종류기인집중유현저부집특정.기중핵심부집기인D4S234E、SST、FGF、IGFR、FGFR화IGFBP등적고표체여촉진종류형성급내약상관.재생물학과정상,FA환자세포외분자적생물합성화결구여대조조구유현저차이.재결구기인조상관분석중발현,포함상술IGF2재내적전록기시위점부근구유모체RRCAGGTGNCV급CCTNTMAGA적기인집구유부집특정,기중전자여종류발생적관건전록인자TCF3필배.결론 FA환자적고종류역감성여기체내재관건전록인자개도하적종류상관세포인자、격소등내배경변화밀절상관.
