CAJ | 학술논문

目的:采用人工神经网络模型及在线软件BIMAS和SYFPEITHI共同预测汉滩病毒核蛋白HLA-A·02限制的CTL表位,并对CTL表位进行实验鉴定.方法:①选取2004-11解放军第四军医大学唐都医院住院的肾综合征出血热患者1例,汉滩病毒特异性IgM抗体为阳性.无菌抽取肾综合征出血热患者外周血,分离外周血单个核细胞,液氮冻存备用.②采用JavaNNS软件模拟神经系统对信息的处理过程,建立人工神经网络模型.训练人工神经网络的9肽包括584种HLA-A·02结合肽和130种HLA-A·02非结合肽,随机数字表法分为3部分:80%为训练肽(用来训练模型,使其学习其中隐含的规律),10%为确认肽(防止训练过度,使训练在适当的时候终止),10%为试验肽(对训练好的模型进行初步的评价).无、低、中、高亲和力9肽训练人工神经网络的输出值分别为0.1,0.4,0.6,0.8.因此,人工神经网络模型的默认阈值为0.4.此外,还应用在线软件BIMAS和SYFPEITHI,共同预测汉滩病毒核蛋白的CTL表位.③采用ELISPOT鉴定汉滩病毒核蛋白特异的HLA-A·02限制的CTL表位.结果:①人工神经网络、BIMAS和SYFPEITHI预测的准确度:3种方法预测的灵敏度分别达到0.89,0.78,0.97,特异性分别为0.90,0.87,0.20.三者共同预测到23个汉滩病毒核蛋白特异的CTL表位.②HLA-A·02限制的CTL表位的实验鉴定:在可刺激肾综合征出血热患者外周血单个核细胞产生阳性反应的3条15肽中,预测到了4个HLA-A·02限制的CTL表位.经ELISPOT实验证实,其中的2种9肽可刺激HLA-A·02阳性的肾综合征出血热患者外周血单个核细胞分泌γ干扰素.结论:肾综合征出血热患者中存在着汉滩病毒特异的CTL应答.汉滩病毒核蛋白CTL表位的有效预测,大幅度减少了合成候选9肽的数量,降低了成本.为肾综合征出血热细胞免疫应答的研究以及多肽疫苗的设计,奠定了重要基础.
목적:채용인공신경망락모형급재선연건BIMAS화SYFPEITHI공동예측한탄병독핵단백HLA-A·02한제적CTL표위,병대CTL표위진행실험감정.방법:①선취2004-11해방군제사군의대학당도의원주원적신종합정출혈열환자1례,한탄병독특이성IgM항체위양성.무균추취신종합정출혈열환자외주혈,분리외주혈단개핵세포,액담동존비용.②채용JavaNNS연건모의신경계통대신식적처리과정,건립인공신경망락모형.훈련인공신경망락적9태포괄584충HLA-A·02결합태화130충HLA-A·02비결합태,수궤수자표법분위3부분:80%위훈련태(용래훈련모형,사기학습기중은함적규률),10%위학인태(방지훈련과도,사훈련재괄당적시후종지),10%위시험태(대훈련호적모형진행초보적평개).무、저、중、고친화력9태훈련인공신경망락적수출치분별위0.1,0.4,0.6,0.8.인차,인공신경망락모형적묵인역치위0.4.차외,환응용재선연건BIMAS화SYFPEITHI,공동예측한탄병독핵단백적CTL표위.③채용ELISPOT감정한탄병독핵단백특이적HLA-A·02한제적CTL표위.결과:①인공신경망락、BIMAS화SYFPEITHI예측적준학도:3충방법예측적령민도분별체도0.89,0.78,0.97,특이성분별위0.90,0.87,0.20.삼자공동예측도23개한탄병독핵단백특이적CTL표위.②HLA-A·02한제적CTL표위적실험감정:재가자격신종합정출혈열환자외주혈단개핵세포산생양성반응적3조15태중,예측도료4개HLA-A·02한제적CTL표위.경ELISPOT실험증실,기중적2충9태가자격HLA-A·02양성적신종합정출혈열환자외주혈단개핵세포분비γ간우소.결론:신종합정출혈열환자중존재착한탄병독특이적CTL응답.한탄병독핵단백CTL표위적유효예측,대폭도감소료합성후선9태적수량,강저료성본.위신종합정출혈열세포면역응답적연구이급다태역묘적설계,전정료중요기출.