生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2009年
2期
108-112,139
,共6页
水溶性环氧化合物水解酶(EH)%生物信息学%水稻
水溶性環氧化閤物水解酶(EH)%生物信息學%水稻
수용성배양화합물수해매(EH)%생물신식학%수도
水溶性环氧化合物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase,SEH)是一组催化环氧化合物水解为相应邻位二醇的酶类,在哺乳动物、植物、昆虫和微生物体内广泛存在.通过BLAST对水稻基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得10个水溶性环氧化物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase SEH)sEH蛋白的同源序列.经分析发现这些基因在水稻不同胁迫处理下各个部位都有所表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异.水稻sEH蛋白主要参与角质层形成,应激反应,以及病原防御等生理过程,特别在脱毒过程中扮演着重要的角色.对蛋白质多序列联配和三级结构预测结果表明:水溶性环氧化合物水解酶的核心结构域由3个催化残基Asp、His和Asp形成三位一体的催化活性构象.这类基因的表达受抗逆环境诱导,其功能与抗逆性有关,为基因工程抗逆育种提供了参考.
水溶性環氧化閤物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase,SEH)是一組催化環氧化閤物水解為相應鄰位二醇的酶類,在哺乳動物、植物、昆蟲和微生物體內廣汎存在.通過BLAST對水稻基因組的蛋白質數據庫進行搜索,穫得10箇水溶性環氧化物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase SEH)sEH蛋白的同源序列.經分析髮現這些基因在水稻不同脅迫處理下各箇部位都有所錶達,而且不同成員之間的錶達模式存在較大的差異.水稻sEH蛋白主要參與角質層形成,應激反應,以及病原防禦等生理過程,特彆在脫毒過程中扮縯著重要的角色.對蛋白質多序列聯配和三級結構預測結果錶明:水溶性環氧化閤物水解酶的覈心結構域由3箇催化殘基Asp、His和Asp形成三位一體的催化活性構象.這類基因的錶達受抗逆環境誘導,其功能與抗逆性有關,為基因工程抗逆育種提供瞭參攷.
수용성배양화합물수해매(Soluble Epoxide Hydrolase,SEH)시일조최화배양화합물수해위상응린위이순적매류,재포유동물、식물、곤충화미생물체내엄범존재.통과BLAST대수도기인조적단백질수거고진행수색,획득10개수용성배양화물수해매(Soluble Epoxide Hydrolase SEH)sEH단백적동원서렬.경분석발현저사기인재수도불동협박처리하각개부위도유소표체,이차불동성원지간적표체모식존재교대적차이.수도sEH단백주요삼여각질층형성,응격반응,이급병원방어등생리과정,특별재탈독과정중분연착중요적각색.대단백질다서렬련배화삼급결구예측결과표명:수용성배양화합물수해매적핵심결구역유3개최화잔기Asp、His화Asp형성삼위일체적최화활성구상.저류기인적표체수항역배경유도,기공능여항역성유관,위기인공정항역육충제공료삼고.
