天津科技大学学报
天津科技大學學報
천진과기대학학보
JOURNAL OF TIANJIN UNIVERSITY OF SCIENCE & TECHNOLOGY
2011年
5期
72-75
,共4页
真核生物%基因组%isochore%Z曲线%Shannon熵
真覈生物%基因組%isochore%Z麯線%Shannon熵
진핵생물%기인조%isochore%Z곡선%Shannon적
高等真核生物基因组的isochore结构与许多重要的生物学特征相关,而对其边界的确定则是isochore结构分析的重点,同时也是难点.针对基于Z曲线的累积GC轮廓图法、基于Shannon熵的递归分段算法以及基于二次散度的分段算法三种典型的应用,分析出其分段依据本质上是对于基因组序列求取碱基对换对称性的对称中心.基于此结果,在寻找isochore结构分析度量时,只要度量函数满足一定对换对称性要求,即可达到殊途同归的目的.
高等真覈生物基因組的isochore結構與許多重要的生物學特徵相關,而對其邊界的確定則是isochore結構分析的重點,同時也是難點.針對基于Z麯線的纍積GC輪廓圖法、基于Shannon熵的遞歸分段算法以及基于二次散度的分段算法三種典型的應用,分析齣其分段依據本質上是對于基因組序列求取堿基對換對稱性的對稱中心.基于此結果,在尋找isochore結構分析度量時,隻要度量函數滿足一定對換對稱性要求,即可達到殊途同歸的目的.
고등진핵생물기인조적isochore결구여허다중요적생물학특정상관,이대기변계적학정칙시isochore결구분석적중점,동시야시난점.침대기우Z곡선적루적GC륜곽도법、기우Shannon적적체귀분단산법이급기우이차산도적분단산법삼충전형적응용,분석출기분단의거본질상시대우기인조서렬구취감기대환대칭성적대칭중심.기우차결과,재심조isochore결구분석도량시,지요도량함수만족일정대환대칭성요구,즉가체도수도동귀적목적.
