放射免疫学杂志
放射免疫學雜誌
방사면역학잡지
JOURNAL OF RADIOMMUNOLOGY
2012年
3期
307-310
,共4页
蛋白芯片%春季卡他性结膜炎%生物标志物
蛋白芯片%春季卡他性結膜炎%生物標誌物
단백심편%춘계잡타성결막염%생물표지물
目的 探讨用蛋白质芯片技术筛选春季卡他性结膜炎(vernal keratoconjunctivis,VKC)患者泪液中蛋白质表达谱,寻找泪液中的标志性蛋白.方法 采用表面增强激光解离飞行时间质谱技术(surface-enhanced laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS),运用CM10蛋白质芯片检测66例VKC患者和62例正常对照组泪液中蛋白质谱,获得的蛋白质谱采用Biomarker Wizard软件分析,初步筛选蛋白质峰,结合生物信息学的支持向量机(support vector machines,SVM)方法建立并测试VKC患者泪液中的蛋白质指纹图谱模型.结果 在芯片上捕获到145种蛋白质,用质谱仪筛选出VKC患者与正常对照组相比的23种差异蛋白,从中再次筛选出3种蛋白质组成VKC的蛋白质谱最优化模型,VKC患者泪液中质荷比(m/z)分别为2024.3,6630.2和8598.9的3种蛋白质表达上调.模型经三倍交叉验证后用盲法测定,其敏感性和特异性分别为90.91%和93.55%,阳性预测值为93.75%.结论 蛋白质芯片技术可快速、有效地筛选出VKC患者泪液差异蛋白,结合SVM可建立一个由3种蛋白质组成的蛋白质指纹图谱模型,可对VKC做很好的诊断预测,对这3种蛋白质尤其是m/z为2024.8的蛋白质进行研究,有助于VKC病因学进展及诊断标记物的发现.
目的 探討用蛋白質芯片技術篩選春季卡他性結膜炎(vernal keratoconjunctivis,VKC)患者淚液中蛋白質錶達譜,尋找淚液中的標誌性蛋白.方法 採用錶麵增彊激光解離飛行時間質譜技術(surface-enhanced laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS),運用CM10蛋白質芯片檢測66例VKC患者和62例正常對照組淚液中蛋白質譜,穫得的蛋白質譜採用Biomarker Wizard軟件分析,初步篩選蛋白質峰,結閤生物信息學的支持嚮量機(support vector machines,SVM)方法建立併測試VKC患者淚液中的蛋白質指紋圖譜模型.結果 在芯片上捕穫到145種蛋白質,用質譜儀篩選齣VKC患者與正常對照組相比的23種差異蛋白,從中再次篩選齣3種蛋白質組成VKC的蛋白質譜最優化模型,VKC患者淚液中質荷比(m/z)分彆為2024.3,6630.2和8598.9的3種蛋白質錶達上調.模型經三倍交扠驗證後用盲法測定,其敏感性和特異性分彆為90.91%和93.55%,暘性預測值為93.75%.結論 蛋白質芯片技術可快速、有效地篩選齣VKC患者淚液差異蛋白,結閤SVM可建立一箇由3種蛋白質組成的蛋白質指紋圖譜模型,可對VKC做很好的診斷預測,對這3種蛋白質尤其是m/z為2024.8的蛋白質進行研究,有助于VKC病因學進展及診斷標記物的髮現.
목적 탐토용단백질심편기술사선춘계잡타성결막염(vernal keratoconjunctivis,VKC)환자루액중단백질표체보,심조루액중적표지성단백.방법 채용표면증강격광해리비행시간질보기술(surface-enhanced laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS),운용CM10단백질심편검측66례VKC환자화62례정상대조조루액중단백질보,획득적단백질보채용Biomarker Wizard연건분석,초보사선단백질봉,결합생물신식학적지지향량궤(support vector machines,SVM)방법건립병측시VKC환자루액중적단백질지문도보모형.결과 재심편상포획도145충단백질,용질보의사선출VKC환자여정상대조조상비적23충차이단백,종중재차사선출3충단백질조성VKC적단백질보최우화모형,VKC환자루액중질하비(m/z)분별위2024.3,6630.2화8598.9적3충단백질표체상조.모형경삼배교차험증후용맹법측정,기민감성화특이성분별위90.91%화93.55%,양성예측치위93.75%.결론 단백질심편기술가쾌속、유효지사선출VKC환자루액차이단백,결합SVM가건립일개유3충단백질조성적단백질지문도보모형,가대VKC주흔호적진단예측,대저3충단백질우기시m/z위2024.8적단백질진행연구,유조우VKC병인학진전급진단표기물적발현.
