华北农学报
華北農學報
화북농학보
ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA
2012年
2期
50-54
,共5页
柱型苹果%MADS-box%SOC1基因%基因克隆
柱型蘋果%MADS-box%SOC1基因%基因剋隆
주형평과%MADS-box%SOC1기인%기인극륭
基于笔者前期进行的柱型苹果转录组测序(RNA-seq)结果,采用RT-PCR方法,从柱型苹果花芽中克隆了MADS-box基因家族的2个同源基因,分别命名为MdSOCla和MdSOClb.分析结果表明,MdSOCla开放阅读框长度为708 bp,编码235个氨基酸,蛋白质分子量为26.95 kDa,等电点为9.13；MdSOClb开放阅读框长度为717 bp,编码238个氨基酸,蛋白质分子量为27.49 kDa,等电点为9.61.MdSOCla和MdSOClb的编码区碱基序列相似性为83.49％,氨基酸的相似性为73.72％.MdSOCla和MdSOClb的第1- 75个氨基酸为高度保守的MADS盒结构域,第105～170个为K盒结构域.在构建的SOC1系统进化树中,MdSOCla与MdSOClb与苹果SOC1关系最近,其次为橙SOC1,与拟南芥SOC1同源基因进化关系最远.苹果、橙、大岩桐关系较近而聚为一类,而大豆、豇豆、葡萄、拟南芥、草莓和玉兰聚为一类.蛋白质二级结构预测显示,MdSOCla蛋白有8个α-螺旋,5个β折叠区,13个β-转角；而MdSOClb蛋白有11个α-螺旋,7个β折叠区,11个β-转角.推测二者在花的发育中可能起不同的调控作用.
基于筆者前期進行的柱型蘋果轉錄組測序(RNA-seq)結果,採用RT-PCR方法,從柱型蘋果花芽中剋隆瞭MADS-box基因傢族的2箇同源基因,分彆命名為MdSOCla和MdSOClb.分析結果錶明,MdSOCla開放閱讀框長度為708 bp,編碼235箇氨基痠,蛋白質分子量為26.95 kDa,等電點為9.13；MdSOClb開放閱讀框長度為717 bp,編碼238箇氨基痠,蛋白質分子量為27.49 kDa,等電點為9.61.MdSOCla和MdSOClb的編碼區堿基序列相似性為83.49％,氨基痠的相似性為73.72％.MdSOCla和MdSOClb的第1- 75箇氨基痠為高度保守的MADS盒結構域,第105～170箇為K盒結構域.在構建的SOC1繫統進化樹中,MdSOCla與MdSOClb與蘋果SOC1關繫最近,其次為橙SOC1,與擬南芥SOC1同源基因進化關繫最遠.蘋果、橙、大巖桐關繫較近而聚為一類,而大豆、豇豆、葡萄、擬南芥、草莓和玉蘭聚為一類.蛋白質二級結構預測顯示,MdSOCla蛋白有8箇α-螺鏇,5箇β摺疊區,13箇β-轉角；而MdSOClb蛋白有11箇α-螺鏇,7箇β摺疊區,11箇β-轉角.推測二者在花的髮育中可能起不同的調控作用.
기우필자전기진행적주형평과전록조측서(RNA-seq)결과,채용RT-PCR방법,종주형평과화아중극륭료MADS-box기인가족적2개동원기인,분별명명위MdSOCla화MdSOClb.분석결과표명,MdSOCla개방열독광장도위708 bp,편마235개안기산,단백질분자량위26.95 kDa,등전점위9.13；MdSOClb개방열독광장도위717 bp,편마238개안기산,단백질분자량위27.49 kDa,등전점위9.61.MdSOCla화MdSOClb적편마구감기서렬상사성위83.49％,안기산적상사성위73.72％.MdSOCla화MdSOClb적제1- 75개안기산위고도보수적MADS합결구역,제105～170개위K합결구역.재구건적SOC1계통진화수중,MdSOCla여MdSOClb여평과SOC1관계최근,기차위등SOC1,여의남개SOC1동원기인진화관계최원.평과、등、대암동관계교근이취위일류,이대두、강두、포도、의남개、초매화옥란취위일류.단백질이급결구예측현시,MdSOCla단백유8개α-라선,5개β절첩구,13개β-전각；이MdSOClb단백유11개α-라선,7개β절첩구,11개β-전각.추측이자재화적발육중가능기불동적조공작용.
