遗传学报
遺傳學報
유전학보
ACTA GENETICA SINICA
2004年
4期
389-394
,共6页
刘晋袆%安倩%张建军%雷文东%程书钧%高燕宁
劉晉袆%安倩%張建軍%雷文東%程書鈞%高燕寧
류진위%안천%장건군%뢰문동%정서균%고연저
肺癌%DNA甲基化%表遗传学改变%甲基化敏感性随机引物PCR
肺癌%DNA甲基化%錶遺傳學改變%甲基化敏感性隨機引物PCR
폐암%DNA갑기화%표유전학개변%갑기화민감성수궤인물PCR
关于DNA甲基化在肿瘤中的作用的研究,大多集中在研究已知的抑癌基因启动子区的异常高甲基化.而一些未知的参与肿瘤发生的基因也可能受甲基化调控,寻找这些与肿瘤相关的基因,对深入了解肿瘤发生的机制具有重要意义.利用甲基化敏感性随机引物PCR(Methylation-Sensitive Arbitrarily Primed PCR,MS-AP-PCR),检查了肺癌组织中基因组范围内CpG岛高甲基化情况,分离到8个高甲基化片段(hypermethylated DNA fragment,HMDF).通过克隆、测序和Blast、NewCpGseek软件分析,发现所有的片段均为典型的CpG岛,有4个片段与人2、7、9、10号染色体上的同源性为99%~100%,但只有1个是已知的基因.进一步利用Neural Network Promoter Prediction、TSSG和TSSW等软件对其余7个片段可能的生物学意义进行了分析,结果有4个片段是候选的启动子区,提示它们可能源于新基因.所获得的高甲基化片段可能是中国人肺癌发生过程中特有的表遗传学改变.
關于DNA甲基化在腫瘤中的作用的研究,大多集中在研究已知的抑癌基因啟動子區的異常高甲基化.而一些未知的參與腫瘤髮生的基因也可能受甲基化調控,尋找這些與腫瘤相關的基因,對深入瞭解腫瘤髮生的機製具有重要意義.利用甲基化敏感性隨機引物PCR(Methylation-Sensitive Arbitrarily Primed PCR,MS-AP-PCR),檢查瞭肺癌組織中基因組範圍內CpG島高甲基化情況,分離到8箇高甲基化片段(hypermethylated DNA fragment,HMDF).通過剋隆、測序和Blast、NewCpGseek軟件分析,髮現所有的片段均為典型的CpG島,有4箇片段與人2、7、9、10號染色體上的同源性為99%~100%,但隻有1箇是已知的基因.進一步利用Neural Network Promoter Prediction、TSSG和TSSW等軟件對其餘7箇片段可能的生物學意義進行瞭分析,結果有4箇片段是候選的啟動子區,提示它們可能源于新基因.所穫得的高甲基化片段可能是中國人肺癌髮生過程中特有的錶遺傳學改變.
관우DNA갑기화재종류중적작용적연구,대다집중재연구이지적억암기인계동자구적이상고갑기화.이일사미지적삼여종류발생적기인야가능수갑기화조공,심조저사여종류상관적기인,대심입료해종류발생적궤제구유중요의의.이용갑기화민감성수궤인물PCR(Methylation-Sensitive Arbitrarily Primed PCR,MS-AP-PCR),검사료폐암조직중기인조범위내CpG도고갑기화정황,분리도8개고갑기화편단(hypermethylated DNA fragment,HMDF).통과극륭、측서화Blast、NewCpGseek연건분석,발현소유적편단균위전형적CpG도,유4개편단여인2、7、9、10호염색체상적동원성위99%~100%,단지유1개시이지적기인.진일보이용Neural Network Promoter Prediction、TSSG화TSSW등연건대기여7개편단가능적생물학의의진행료분석,결과유4개편단시후선적계동자구,제시타문가능원우신기인.소획득적고갑기화편단가능시중국인폐암발생과정중특유적표유전학개변.