计算机应用研究
計算機應用研究
계산궤응용연구
APPLICATION RESEARCH OF COMPUTERS
2012年
7期
2432-2434
,共3页
分子动力学%并行计算%多核处理器%开放式多处理%临界区
分子動力學%併行計算%多覈處理器%開放式多處理%臨界區
분자동역학%병행계산%다핵처리기%개방식다처리%림계구
为提高分子动力学模拟在多核共享内存式服务器上的运算速度,在现有的分子动力学并行算法基础上提出了Multi-Critical算法.该算法使用手动划分力矩阵的方法,使多个线程进入不同名的临界区,并使用分块叠加的方法优化了并行算法,提高了并行效率.实验结果表明,对比之前的Critical算法,该算法的加速比和并行效率均有较大幅度的提高.
為提高分子動力學模擬在多覈共享內存式服務器上的運算速度,在現有的分子動力學併行算法基礎上提齣瞭Multi-Critical算法.該算法使用手動劃分力矩陣的方法,使多箇線程進入不同名的臨界區,併使用分塊疊加的方法優化瞭併行算法,提高瞭併行效率.實驗結果錶明,對比之前的Critical算法,該算法的加速比和併行效率均有較大幅度的提高.
위제고분자동역학모의재다핵공향내존식복무기상적운산속도,재현유적분자동역학병행산법기출상제출료Multi-Critical산법.해산법사용수동화분력구진적방법,사다개선정진입불동명적림계구,병사용분괴첩가적방법우화료병행산법,제고료병행효솔.실험결과표명,대비지전적Critical산법,해산법적가속비화병행효솔균유교대폭도적제고.
