CAJ | 학술논문

为筛选东方山羊豆盐诱导差异性基因,以250 mmoL/L NaCl处理的东方山羊豆cDNA为实验组,未经诱导刺激的为驱动组,利用抑制性消减杂交技术(SSH)构建消减文库并时其部分阳性克隆进行了ESTs序列分析.该消减文库克隆的重组率为92%,插入片段大部分集中在0.2～1kb之间.随机挑取500个克隆进行测序及同源性分析.获得258个cleanESTs,经聚类、拼接,去除冗余序列,共获得132个Unigene,其中舍有32个contigs和100个singlets,该文库的冗余度为24%.对其进行功能预测及分类,得到大量参与信号转导、转录调控、渗透和代谢调节、机体防御以及光作用等过程的相关基因.随机选择非重复的4个差异表达的序列设计引物,以半定量PCR方法验证其消减效率,结果显示,诱导组的表达量显著高于非诱导组,表明该文库有较高质量,且所采用的技术手段有助于快速发现东方山羊豆新功能基因.
위사선동방산양두염유도차이성기인,이250 mmoL/L NaCl처리적동방산양두cDNA위실험조,미경유도자격적위구동조,이용억제성소감잡교기술(SSH)구건소감문고병시기부분양성극륭진행료ESTs서렬분석.해소감문고극륭적중조솔위92%,삽입편단대부분집중재0.2～1kb지간.수궤도취500개극륭진행측서급동원성분석.획득258개cleanESTs,경취류、병접,거제용여서렬,공획득132개Unigene,기중사유32개contigs화100개singlets,해문고적용여도위24%.대기진행공능예측급분류,득도대량삼여신호전도、전록조공、삼투화대사조절、궤체방어이급광작용등과정적상관기인.수궤선택비중복적4개차이표체적서렬설계인물,이반정량PCR방법험증기소감효솔,결과현시,유도조적표체량현저고우비유도조,표명해문고유교고질량,차소채용적기술수단유조우쾌속발현동방산양두신공능기인.