生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2005年
1期
46-52
,共7页
基因上游%内含子%寡核苷酸对%协同作用%酵母基因
基因上遊%內含子%寡覈苷痠對%協同作用%酵母基因
기인상유%내함자%과핵감산대%협동작용%효모기인
前期研究表明,酵母高转录基因内含子与低转录基因内含子的序列结构有较大差异,高转录基因内含子中存在一些潜在的正调控位点,而且这些内含子非常靠近基因上游区,有的内含子甚至位于5'-UTR区.这些结果提示,高转录基因内含子可能参与转录调控,并可能与上游转录调控有协同作用.为探索内含子与上游区的协同作用,将基因上游序列(翻译起始点上游800bp或两个相邻基因之间部分)取出,仍使用寡核苷酸频率比较方法,抽提出高转录基因上游区可能的转录正调控元件,这些元件与实验所得结果吻合得较好.然后定义"寡核苷酸对",其中一个位于上游区,另一个位于内含子,对"最近距离"在一定范围内(84 bp)的寡核苷酸对进行分析,抽提出匹配基因数显著高于随机匹配数的寡核苷酸对(主要是四核苷酸对和五核苷酸对),分析这些寡核苷酸对的相互作用模式(位置分布及可能的作用因子,如RAP1,ABF1和TAF等),获得了酵母基因上游与内含子之间可能存在的一些转录协同作用模式.这些结果有助于对基因转录调控机制的认识.
前期研究錶明,酵母高轉錄基因內含子與低轉錄基因內含子的序列結構有較大差異,高轉錄基因內含子中存在一些潛在的正調控位點,而且這些內含子非常靠近基因上遊區,有的內含子甚至位于5'-UTR區.這些結果提示,高轉錄基因內含子可能參與轉錄調控,併可能與上遊轉錄調控有協同作用.為探索內含子與上遊區的協同作用,將基因上遊序列(翻譯起始點上遊800bp或兩箇相鄰基因之間部分)取齣,仍使用寡覈苷痠頻率比較方法,抽提齣高轉錄基因上遊區可能的轉錄正調控元件,這些元件與實驗所得結果吻閤得較好.然後定義"寡覈苷痠對",其中一箇位于上遊區,另一箇位于內含子,對"最近距離"在一定範圍內(84 bp)的寡覈苷痠對進行分析,抽提齣匹配基因數顯著高于隨機匹配數的寡覈苷痠對(主要是四覈苷痠對和五覈苷痠對),分析這些寡覈苷痠對的相互作用模式(位置分佈及可能的作用因子,如RAP1,ABF1和TAF等),穫得瞭酵母基因上遊與內含子之間可能存在的一些轉錄協同作用模式.這些結果有助于對基因轉錄調控機製的認識.
전기연구표명,효모고전록기인내함자여저전록기인내함자적서렬결구유교대차이,고전록기인내함자중존재일사잠재적정조공위점,이차저사내함자비상고근기인상유구,유적내함자심지위우5'-UTR구.저사결과제시,고전록기인내함자가능삼여전록조공,병가능여상유전록조공유협동작용.위탐색내함자여상유구적협동작용,장기인상유서렬(번역기시점상유800bp혹량개상린기인지간부분)취출,잉사용과핵감산빈솔비교방법,추제출고전록기인상유구가능적전록정조공원건,저사원건여실험소득결과문합득교호.연후정의"과핵감산대",기중일개위우상유구,령일개위우내함자,대"최근거리"재일정범위내(84 bp)적과핵감산대진행분석,추제출필배기인수현저고우수궤필배수적과핵감산대(주요시사핵감산대화오핵감산대),분석저사과핵감산대적상호작용모식(위치분포급가능적작용인자,여RAP1,ABF1화TAF등),획득료효모기인상유여내함자지간가능존재적일사전록협동작용모식.저사결과유조우대기인전록조공궤제적인식.